More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6693 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 726 aa  1494    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  76.23 
 
 		 727 aa  1154    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  78.06 
 
 		 727 aa  1171    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  55.71 
 
 		 728 aa  809    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  39.04 
 
 		 742 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  37.87 
 
 		 707 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  37.87 
 
 		 707 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  37.87 
 
 		 707 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  37.32 
 
 		 738 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  38.26 
 
 		 706 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 		 685 aa  353  5e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 715 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 774 aa  273  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 730 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 716 aa  247  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 719 aa  242  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  29.18 
 
 		 744 aa  241  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 811 aa  240  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 727 aa  240  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 729 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 708 aa  238  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 712 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 728 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 811 aa  237  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 710 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 802 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 710 aa  230  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  29.42 
 
 		 804 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 718 aa  228  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 725 aa  227  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 808 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 757 aa  225  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 726 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  28.48 
 
 		 755 aa  223  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 737 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 772 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 772 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.57 
 
 		 705 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 729 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 754 aa  220  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  29.22 
 
 		 804 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 772 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 750 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 710 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 742 aa  218  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  28.99 
 
 		 730 aa  218  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 		 809 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 751 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 768 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 730 aa  214  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 823 aa  213  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 702 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 722 aa  212  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 702 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 729 aa  211  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 743 aa  209  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 729 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 743 aa  207  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 800 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  28.67 
 
 		 737 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 805 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 722 aa  204  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 728 aa  204  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 753 aa  204  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 777 aa  203  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 743 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  28.66 
 
 		 771 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 746 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 728 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 743 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 743 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1495  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.29 
 
 		 711 aa  200  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.454643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 819 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 749 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  26.79 
 
 		 746 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 804 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  27.29 
 
 		 804 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 801 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.82 
 
 		 724 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 801 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 731 aa  195  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 724 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 734 aa  193  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 764 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 698 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 762 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 708 aa  184  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  25 
 
 		 704 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 756 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 761 aa  180  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 712 aa  179  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 724 aa  177  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 761 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 378 aa  174  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 729 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 758 aa  171  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 753 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  26.86 
 
 		 720 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1560  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 714 aa  166  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.3619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>