More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1610 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  68.4 
 
 		 729 aa  952    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  68.4 
 
 		 710 aa  954    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  100 
 
 		 724 aa  1481    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  56.56 
 
 		 704 aa  784    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  90.33 
 
 		 724 aa  1328    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  52.23 
 
 		 751 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  50.5 
 
 		 743 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  51.36 
 
 		 743 aa  689    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  67.62 
 
 		 712 aa  962    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  51.36 
 
 		 743 aa  689    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  51.5 
 
 		 743 aa  691    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  51.51 
 
 		 743 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  68.1 
 
 		 710 aa  950    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  51.51 
 
 		 743 aa  691    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  49.47 
 
 		 729 aa  628  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  38.78 
 
 		 719 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 729 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1495  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.67 
 
 		 711 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.454643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 		 698 aa  270  8e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  31.26 
 
 		 705 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 811 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 702 aa  252  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 702 aa  249  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 708 aa  238  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 811 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 718 aa  235  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 708 aa  232  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 730 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 774 aa  224  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 716 aa  223  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 754 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 801 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 800 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 727 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  29.09 
 
 		 804 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 802 aa  219  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 727 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 801 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 707 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 707 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 707 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 772 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 772 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 809 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 823 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 726 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 727 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 728 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 722 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 729 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 738 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 715 aa  211  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  29.33 
 
 		 737 aa  211  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  28.57 
 
 		 804 aa  211  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 757 aa  210  9e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 		 722 aa  207  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  27.28 
 
 		 714 aa  206  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 777 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 768 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 805 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 730 aa  204  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 710 aa  204  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 762 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 728 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 712 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 753 aa  201  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 755 aa  201  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 737 aa  201  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 728 aa  200  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 726 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 709 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 703 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  27.77 
 
 		 746 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 808 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 712 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  27.87 
 
 		 730 aa  197  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 702 aa  197  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 709 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 753 aa  195  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 734 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 710 aa  194  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 742 aa  193  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 819 aa  193  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  26.9 
 
 		 744 aa  193  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 749 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 742 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 725 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 729 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 706 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 706 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 761 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 706 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 706 aa  190  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 804 aa  187  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 768 aa  186  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 761 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  25.76 
 
 		 763 aa  186  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 697 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  27.87 
 
 		 771 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  25.92 
 
 		 690 aa  185  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>