More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3345 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  96.46 
 
 		 707 aa  1372    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 738 aa  1510    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  55.27 
 
 		 742 aa  760    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  96.46 
 
 		 707 aa  1372    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  96.61 
 
 		 707 aa  1375    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  39.91 
 
 		 727 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  38.74 
 
 		 727 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  39.48 
 
 		 706 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  37.74 
 
 		 728 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  37.3 
 
 		 726 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  38.57 
 
 		 685 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 		 715 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 		 751 aa  266  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 743 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 743 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 743 aa  261  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  30.36 
 
 		 705 aa  256  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 		 743 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 		 743 aa  254  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 		 743 aa  254  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 719 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 710 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 702 aa  249  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 729 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 702 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 729 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 728 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 728 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 716 aa  233  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 712 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 710 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 		 774 aa  230  9e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 772 aa  224  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 772 aa  224  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 737 aa  220  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 		 805 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 730 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.24 
 
 		 704 aa  214  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 729 aa  213  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 722 aa  213  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  29.1 
 
 		 730 aa  212  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 698 aa  211  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 726 aa  212  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 718 aa  211  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 		 819 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 750 aa  207  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.38 
 
 		 724 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 811 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 809 aa  206  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 811 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 729 aa  204  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 758 aa  204  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 		 724 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 772 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 710 aa  197  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  28.91 
 
 		 744 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 724 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  29.6 
 
 		 804 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 727 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 708 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 761 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 755 aa  194  6e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 712 aa  194  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  29.79 
 
 		 737 aa  193  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 823 aa  193  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  29.15 
 
 		 804 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 708 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 757 aa  190  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  29.46 
 
 		 746 aa  189  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  28.2 
 
 		 742 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 722 aa  188  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 753 aa  187  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 729 aa  187  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  28.68 
 
 		 771 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 729 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 725 aa  183  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 731 aa  183  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 756 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 802 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 804 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1495  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.59 
 
 		 711 aa  177  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.454643 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  28.59 
 
 		 804 aa  177  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 753 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 764 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  28.2 
 
 		 763 aa  174  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  28.2 
 
 		 768 aa  173  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  27.83 
 
 		 720 aa  171  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 761 aa  171  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 808 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  27.28 
 
 		 759 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 800 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 801 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 773 aa  162  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 801 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 777 aa  161  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 710 aa  160  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 839 aa  159  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 770 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 768 aa  159  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  25.43 
 
 		 730 aa  158  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>