More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0174 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 772 aa  1591    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  39.97 
 
 		 757 aa  499  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  38.32 
 
 		 750 aa  456  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  39.11 
 
 		 730 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  38.73 
 
 		 727 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  36 
 
 		 716 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 		 718 aa  428  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 774 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  34.77 
 
 		 742 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  28.35 
 
 		 727 aa  277  4e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1610  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 733 aa  268  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 728 aa  262  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 		 728 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1560  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 714 aa  240  6.999999999999999e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.3619  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 378 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 727 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 726 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 727 aa  219  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 706 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 729 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 708 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 710 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 811 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 719 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 751 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 707 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 738 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 811 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 707 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 707 aa  197  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  24.57 
 
 		 712 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 743 aa  191  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 743 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 743 aa  187  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 743 aa  187  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 743 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 743 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 742 aa  185  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  26.78 
 
 		 705 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 710 aa  184  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 728 aa  182  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 698 aa  179  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.63 
 
 		 724 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 730 aa  178  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 724 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 685 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 710 aa  176  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  25.47 
 
 		 744 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 753 aa  176  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  26.45 
 
 		 763 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 768 aa  168  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  27 
 
 		 804 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 702 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 729 aa  167  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  24.4 
 
 		 702 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  27.34 
 
 		 804 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 777 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  26.21 
 
 		 720 aa  165  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 708 aa  163  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  27.3 
 
 		 737 aa  163  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 755 aa  161  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.28 
 
 		 704 aa  160  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 762 aa  160  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 722 aa  160  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 712 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 729 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 715 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 734 aa  158  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 729 aa  158  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 809 aa  158  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 731 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  25.43 
 
 		 761 aa  157  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 805 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 768 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 729 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 802 aa  151  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 772 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 772 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 728 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 749 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 819 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 728 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  24.73 
 
 		 746 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 746 aa  144  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 759 aa  144  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 726 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  23.68 
 
 		 808 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 737 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 839 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 761 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 851 aa  140  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 756 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  24.63 
 
 		 730 aa  139  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  24.08 
 
 		 709 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 725 aa  138  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 724 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 879 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 770 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  24.58 
 
 		 771 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 754 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>