More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0366 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 750 aa  1536    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  40.83 
 
 		 757 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  39.36 
 
 		 774 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  38.21 
 
 		 716 aa  499  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  38.48 
 
 		 742 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  39.63 
 
 		 718 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  38.32 
 
 		 772 aa  456  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 		 730 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  37.43 
 
 		 727 aa  438  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  33.91 
 
 		 727 aa  340  7e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1560  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 714 aa  292  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.3619  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  40.76 
 
 		 378 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1610  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 733 aa  279  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 728 aa  243  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 728 aa  242  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 743 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 743 aa  230  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 708 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 726 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 751 aa  219  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 706 aa  218  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 727 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 811 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 811 aa  213  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 743 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 743 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 743 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 719 aa  211  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 727 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 743 aa  206  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 738 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  27.07 
 
 		 804 aa  203  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  25.51 
 
 		 705 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 707 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 710 aa  201  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 707 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  28.27 
 
 		 804 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 707 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 729 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 710 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 754 aa  194  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 702 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 768 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 712 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  27.9 
 
 		 744 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 702 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.84 
 
 		 704 aa  181  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 729 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1080  TonB dependent receptor  36.2 
 
 		 335 aa  177  7e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 742 aa  177  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 808 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 710 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  26.77 
 
 		 737 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 698 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.99 
 
 		 724 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 729 aa  171  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 755 aa  170  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 753 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 724 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 804 aa  165  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  27.88 
 
 		 746 aa  163  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  28.2 
 
 		 731 aa  163  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 729 aa  160  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 715 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 712 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 762 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 809 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 805 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 685 aa  156  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 749 aa  156  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 802 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  27.86 
 
 		 771 aa  154  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 819 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 761 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  24.21 
 
 		 796 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 728 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 		 796 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 756 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 796 aa  147  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 777 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 772 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 772 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 722 aa  146  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 728 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  24.22 
 
 		 708 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 722 aa  144  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 		 796 aa  144  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  25.14 
 
 		 804 aa  143  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 823 aa  140  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 726 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 734 aa  137  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  25.16 
 
 		 729 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 737 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 746 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 800 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 753 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  22.96 
 
 		 770 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 801 aa  134  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  23.46 
 
 		 710 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 801 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>