More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3007 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  53.09 
 
 
724 aa  715    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  52.5 
 
 
755 aa  764    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  62.78 
 
 
753 aa  871    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
730 aa  1456    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  76.5 
 
 
729 aa  1107    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  67.45 
 
 
737 aa  937    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  43.79 
 
 
772 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  43.79 
 
 
772 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  43.47 
 
 
726 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  43.89 
 
 
737 aa  548  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  42.95 
 
 
761 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  40.3 
 
 
729 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  41.94 
 
 
728 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  41.02 
 
 
728 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  41.55 
 
 
804 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  40.87 
 
 
804 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  40.42 
 
 
734 aa  500  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  40.37 
 
 
805 aa  492  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  38.32 
 
 
720 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  39.38 
 
 
819 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  38.05 
 
 
768 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  40.53 
 
 
809 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  38.05 
 
 
763 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  38.22 
 
 
759 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  40.38 
 
 
725 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  39.12 
 
 
800 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  38.49 
 
 
802 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  39.56 
 
 
804 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  38.5 
 
 
801 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  38.99 
 
 
722 aa  452  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  38.79 
 
 
801 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  38.08 
 
 
771 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  38.82 
 
 
744 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  38.38 
 
 
746 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  40.14 
 
 
823 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  36.07 
 
 
728 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  37.8 
 
 
754 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  37.58 
 
 
722 aa  428  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  38.64 
 
 
753 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  39.33 
 
 
749 aa  425  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  37.11 
 
 
808 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  36.75 
 
 
756 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 
764 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  37.78 
 
 
777 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  37.17 
 
 
762 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  39.19 
 
 
851 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  36.56 
 
 
712 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  39.27 
 
 
879 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  39.54 
 
 
839 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  36.2 
 
 
761 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  36.6 
 
 
764 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  39.16 
 
 
709 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  35.91 
 
 
746 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  37.91 
 
 
758 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  37.1 
 
 
768 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  38.53 
 
 
773 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  36.65 
 
 
700 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 
729 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  38.29 
 
 
773 aa  382  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  34.24 
 
 
730 aa  382  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  37.23 
 
 
770 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  35.12 
 
 
731 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  34.59 
 
 
742 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  33.57 
 
 
804 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 
728 aa  261  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 
729 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 
811 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 
698 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 
710 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 
710 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 
727 aa  234  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 
726 aa  230  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  29.91 
 
 
705 aa  229  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 
811 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 
728 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 
727 aa  226  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 
702 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 
708 aa  223  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 
751 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 
738 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 
716 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 
712 aa  218  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 
743 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 
743 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 
743 aa  217  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.22 
 
 
704 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 
707 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 
774 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 
702 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 
743 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 
707 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 
707 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29 
 
 
724 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 
724 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 
743 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 
708 aa  199  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 
719 aa  198  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 
742 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 
706 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 
772 aa  193  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.191382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>