More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0879 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 378 aa  776    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  81.25 
 
 		 774 aa  630  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  56.64 
 
 		 716 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  40.76 
 
 		 750 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  41.46 
 
 		 727 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  40.27 
 
 		 730 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  39.4 
 
 		 742 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  39.19 
 
 		 718 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  38.18 
 
 		 757 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 772 aa  222  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  35.26 
 
 		 727 aa  211  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1080  TonB dependent receptor  34.72 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1610  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 733 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  33.79 
 
 		 728 aa  182  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  34.4 
 
 		 768 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 727 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 727 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  31.52 
 
 		 804 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  31.52 
 
 		 804 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 726 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 728 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  31.04 
 
 		 754 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  30.6 
 
 		 744 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  32.31 
 
 		 804 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 811 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 709 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 756 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1560  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 714 aa  162  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.3619  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 		 725 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 808 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 712 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 737 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 		 726 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 753 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 734 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 		 811 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.67 
 
 		 704 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 730 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 772 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 772 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 743 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  29.16 
 
 		 771 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 		 708 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 		 729 aa  153  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 761 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 722 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 743 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  30.85 
 
 		 737 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  29.69 
 
 		 700 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 751 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  29.92 
 
 		 755 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 809 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 749 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 722 aa  146  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  30.08 
 
 		 746 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 742 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 743 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 729 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 		 685 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 731 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 743 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 743 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 743 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 764 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 746 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 738 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 761 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 707 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 707 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 729 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 707 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 706 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 698 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 801 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 800 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 801 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 764 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 710 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  29.7 
 
 		 710 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 805 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 710 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 802 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 819 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  32.06 
 
 		 753 aa  133  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 724 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 729 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  26.95 
 
 		 705 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 708 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  28.53 
 
 		 804 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.9 
 
 		 724 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 879 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 762 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 715 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 728 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 851 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 839 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 728 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  29.43 
 
 		 777 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 724 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  32.07 
 
 		 742 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>