240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1198 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 754 aa  1536    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 754 aa  1536    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  36.92 
 
 		 782 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  35.23 
 
 		 740 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  30.96 
 
 		 734 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 790 aa  389  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  35.49 
 
 		 786 aa  379  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  30.49 
 
 		 741 aa  375  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  30.43 
 
 		 740 aa  369  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  30.14 
 
 		 730 aa  355  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 756 aa  354  4e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  53.75 
 
 		 398 aa  350  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  53.75 
 
 		 398 aa  350  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 742 aa  295  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 729 aa  261  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 736 aa  226  9e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 		 285 aa  154  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 747 aa  125  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 746 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 815 aa  108  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  22.57 
 
 		 760 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  22.24 
 
 		 760 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 828 aa  92  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 766 aa  90.9  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 753 aa  87.4  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  22.6 
 
 		 781 aa  86.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 841 aa  82.8  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  26.74 
 
 		 768 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 777 aa  77  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 768 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  20.43 
 
 		 782 aa  70.9  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 738 aa  67.4  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 738 aa  67.4  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 799 aa  66.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 855 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 855 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.86 
 
 		 721 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 858 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.86 
 
 		 706 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.86 
 
 		 706 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  30.43 
 
 		 695 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.86 
 
 		 706 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 749 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.58 
 
 		 706 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  31.61 
 
 		 701 aa  62  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 711 aa  62  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  21.62 
 
 		 766 aa  61.2  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  31.61 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1210  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 506 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  27.18 
 
 		 772 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 742 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 700 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 700 aa  60.1  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 700 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 701 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 720 aa  58.9  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 701 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 796 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 701 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  26.7 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 796 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 737 aa  58.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 700 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 791 aa  58.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 786 aa  57.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 796 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 796 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 707 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.3 
 
 		 700 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.3 
 
 		 700 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 792 aa  56.6  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  29.43 
 
 		 703 aa  56.6  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 747 aa  56.6  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 742 aa  56.2  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 690 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 734 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 706 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 706 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 798 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  25.13 
 
 		 821 aa  54.7  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  39.44 
 
 		 835 aa  54.7  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 863 aa  54.7  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 882 aa  54.7  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 881 aa  54.3  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 881 aa  54.3  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 748 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 798 aa  53.5  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 747 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 690 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 712 aa  53.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 747 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 810 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 768 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>