More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1061 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 691 aa  1373    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  41.24 
 
 		 688 aa  461  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  40.96 
 
 		 675 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  37.32 
 
 		 705 aa  356  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  36.75 
 
 		 678 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 		 731 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 728 aa  304  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 700 aa  299  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 700 aa  299  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  33.47 
 
 		 706 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 700 aa  298  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 700 aa  298  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  33.47 
 
 		 706 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  33.47 
 
 		 706 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 700 aa  297  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  33.47 
 
 		 721 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  33.47 
 
 		 706 aa  296  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 700 aa  296  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  32.21 
 
 		 700 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  32.21 
 
 		 700 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.95 
 
 		 712 aa  296  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 700 aa  294  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 694 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 715 aa  290  9e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  35.25 
 
 		 723 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 709 aa  281  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 697 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 706 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 705 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 720 aa  266  8e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 701 aa  264  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 742 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  31.2 
 
 		 743 aa  252  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  30.73 
 
 		 710 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 706 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  30.25 
 
 		 726 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 736 aa  238  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 680 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 681 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 723 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 770 aa  178  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 780 aa  160  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 703 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 714 aa  146  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  23.26 
 
 		 690 aa  140  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 742 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 757 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 678 aa  137  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 734 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 681 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 681 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 736 aa  130  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 717 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 715 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 688 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 713 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 700 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  21.4 
 
 		 696 aa  128  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 698 aa  127  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 737 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  25.59 
 
 		 727 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 700 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  22.6 
 
 		 762 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 682 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.5 
 
 		 701 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  25.95 
 
 		 712 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 733 aa  120  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 680 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 706 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 688 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 692 aa  110  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 664 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 716 aa  108  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 698 aa  106  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 690 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  23.84 
 
 		 690 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 726 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 702 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 718 aa  99  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  23.86 
 
 		 725 aa  94  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 689 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 688 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  23.64 
 
 		 696 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.64 
 
 		 696 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 683 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 720 aa  88.6  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 711 aa  88.2  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  23.83 
 
 		 683 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 687 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  27.11 
 
 		 692 aa  87  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.44 
 
 		 784 aa  83.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 730 aa  82.8  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 688 aa  82  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  23.32 
 
 		 808 aa  80.5  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  23.85 
 
 		 693 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.64 
 
 		 755 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 791 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 785 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 684 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 712 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>