130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2385 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 799 aa  1633    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  38.71 
 
 		 835 aa  508  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  35.55 
 
 		 753 aa  416  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  35.72 
 
 		 738 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  35.72 
 
 		 738 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 777 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 792 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 747 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 814 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 766 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  34.32 
 
 		 768 aa  366  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 768 aa  366  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 765 aa  344  4e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 777 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 772 aa  300  8e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 772 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 782 aa  191  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 786 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 815 aa  169  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 796 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 780 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 762 aa  147  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 729 aa  137  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 768 aa  135  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 747 aa  134  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 781 aa  131  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 786 aa  126  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 790 aa  124  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  23.41 
 
 		 760 aa  120  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  23.07 
 
 		 760 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 791 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 798 aa  104  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 790 aa  104  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 781 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 808 aa  99  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 841 aa  91.3  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 756 aa  90.1  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 765 aa  89  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 828 aa  85.1  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  21.56 
 
 		 734 aa  84.3  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  21.68 
 
 		 741 aa  82.8  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 746 aa  78.6  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 792 aa  75.5  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 721 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  25 
 
 		 721 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  27.9 
 
 		 740 aa  67.4  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 754 aa  66.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 762 aa  66.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 754 aa  66.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 803 aa  65.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 742 aa  65.5  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 768 aa  64.3  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 768 aa  64.3  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  23.45 
 
 		 740 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 736 aa  62.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 807 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 687 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 762 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 735 aa  58.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  28.19 
 
 		 850 aa  58.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 735 aa  58.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  26.01 
 
 		 730 aa  57.4  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  27.63 
 
 		 778 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 778 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 782 aa  56.2  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 696 aa  53.9  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  25.3 
 
 		 398 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 701 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  25.3 
 
 		 398 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 799 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 		 716 aa  52.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.34 
 
 		 797 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  25 
 
 		 713 aa  52  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 809 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 824 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 769 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  20.48 
 
 		 711 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.65 
 
 		 766 aa  51.6  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 799 aa  51.6  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  23.01 
 
 		 809 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 797 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 778 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 705 aa  50.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 707 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 727 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  25.94 
 
 		 713 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 756 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  22.27 
 
 		 809 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  21.9 
 
 		 736 aa  49.3  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  22.88 
 
 		 809 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  25.52 
 
 		 713 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 667 aa  49.3  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 788 aa  48.5  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 717 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  24.11 
 
 		 696 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  24.11 
 
 		 696 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.88 
 
 		 726 aa  48.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 780 aa  48.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 704 aa  47.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 856 aa  48.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>