More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21730 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  77.15 
 
 
809 aa  1126    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  53.17 
 
 
723 aa  705    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  77 
 
 
809 aa  1125    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  75.47 
 
 
807 aa  1094    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  52.01 
 
 
720 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  95.01 
 
 
721 aa  1395    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  55.88 
 
 
731 aa  768    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  54.17 
 
 
717 aa  754    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  77 
 
 
809 aa  1125    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  75.84 
 
 
809 aa  1111    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 
721 aa  1474    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  53.36 
 
 
687 aa  719    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  47.45 
 
 
774 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  45.99 
 
 
782 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  46.13 
 
 
782 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  46.79 
 
 
777 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  45.15 
 
 
774 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  45.29 
 
 
774 aa  586  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  45.15 
 
 
774 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  47.28 
 
 
774 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  47 
 
 
784 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  46.71 
 
 
784 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  45.15 
 
 
774 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  45.15 
 
 
774 aa  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  44.76 
 
 
784 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  41.1 
 
 
708 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  41.82 
 
 
693 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  34.47 
 
 
675 aa  343  5e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 
696 aa  323  8e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 
703 aa  323  9.000000000000001e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 
688 aa  303  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  31.4 
 
 
712 aa  300  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 
704 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 
710 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  30.54 
 
 
690 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 
711 aa  257  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.82 
 
 
713 aa  254  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 
731 aa  244  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  28 
 
 
782 aa  204  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 
751 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
729 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 
727 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 
727 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 
730 aa  137  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 
738 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 
700 aa  132  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  30.36 
 
 
518 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 
728 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 
734 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 
664 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  24.55 
 
 
737 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.09 
 
 
705 aa  117  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  26.11 
 
 
706 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  26.11 
 
 
721 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  26.11 
 
 
706 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  26.11 
 
 
706 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 
747 aa  114  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  26.11 
 
 
706 aa  114  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  24.69 
 
 
744 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  24.58 
 
 
744 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 
700 aa  107  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  24.5 
 
 
744 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  23.98 
 
 
746 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
700 aa  105  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 
688 aa  105  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
700 aa  105  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
700 aa  103  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  22.62 
 
 
690 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
700 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 
700 aa  102  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  25.55 
 
 
700 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  25.55 
 
 
700 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 
701 aa  101  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
700 aa  100  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  23.74 
 
 
713 aa  100  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 
657 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 
675 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 
773 aa  100  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 
709 aa  99.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  25.83 
 
 
743 aa  99  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  23.63 
 
 
664 aa  97.8  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 
798 aa  94.4  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  22.4 
 
 
846 aa  92.8  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 
705 aa  92.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  23.14 
 
 
810 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
736 aa  90.9  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 
731 aa  90.9  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 
679 aa  90.9  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  22.25 
 
 
718 aa  90.5  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.59 
 
 
750 aa  90.5  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 
714 aa  89  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 
731 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 
715 aa  89  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  19.72 
 
 
807 aa  88.6  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  21.81 
 
 
702 aa  88.6  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 
681 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 
659 aa  87.4  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 
644 aa  87.4  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  23.22 
 
 
808 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  24.68 
 
 
760 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>