More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02512 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 777 aa  1584    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  44.9 
 
 		 747 aa  618  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  40.16 
 
 		 738 aa  538  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  40.16 
 
 		 738 aa  538  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  40.86 
 
 		 768 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  40.68 
 
 		 768 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  39.95 
 
 		 765 aa  508  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  40.13 
 
 		 772 aa  488  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  38.42 
 
 		 753 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  38.94 
 
 		 792 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  39.51 
 
 		 766 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 777 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 799 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 814 aa  316  8e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 835 aa  281  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 772 aa  211  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 796 aa  207  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 780 aa  191  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 791 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 768 aa  182  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 762 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 786 aa  174  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 815 aa  173  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 790 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 781 aa  158  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 747 aa  158  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  24.57 
 
 		 760 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 808 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  24.77 
 
 		 760 aa  154  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 782 aa  147  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 729 aa  146  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 742 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 746 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.92 
 
 		 766 aa  110  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 792 aa  97.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 841 aa  92  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 828 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 768 aa  86.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 768 aa  86.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 735 aa  85.1  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 735 aa  85.1  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 753 aa  84  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 736 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 730 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 724 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 723 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  23.27 
 
 		 740 aa  77.8  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  21.96 
 
 		 730 aa  77.4  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 724 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5745  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 691 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000026559  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  29.09 
 
 		 734 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  22.82 
 
 		 693 aa  74.3  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 715 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  26.22 
 
 		 740 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 798 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  26.59 
 
 		 741 aa  72.4  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  25.93 
 
 		 765 aa  70.1  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  27.83 
 
 		 737 aa  70.1  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 707 aa  70.1  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  21.66 
 
 		 711 aa  70.1  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 756 aa  67.8  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 786 aa  67.4  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 790 aa  67  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  22.98 
 
 		 803 aa  67  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 761 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 795 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 795 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 705 aa  65.5  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.84 
 
 		 704 aa  64.3  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  22.15 
 
 		 742 aa  63.9  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 751 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 721 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 710 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 701 aa  62.4  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  23.4 
 
 		 781 aa  62.4  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 721 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  25.09 
 
 		 784 aa  62.4  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  23.88 
 
 		 755 aa  62.4  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  23.08 
 
 		 819 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  23.36 
 
 		 777 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 714 aa  62  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  22.48 
 
 		 721 aa  62  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  20.22 
 
 		 724 aa  62  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 730 aa  62  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 		 743 aa  62  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 677 aa  62  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 831 aa  61.2  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 729 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 714 aa  61.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 743 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 796 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 743 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 743 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  23.15 
 
 		 810 aa  60.8  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  22.91 
 
 		 805 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 757 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  22.4 
 
 		 729 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 753 aa  60.1  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>