More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4483 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  93.75 
 
 		 768 aa  1491    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  100 
 
 		 768 aa  1575    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  44.89 
 
 		 747 aa  617  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  44.16 
 
 		 765 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  40.85 
 
 		 738 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  40.85 
 
 		 738 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  41.85 
 
 		 777 aa  521  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  41.85 
 
 		 772 aa  519  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  40.13 
 
 		 777 aa  479  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  37.98 
 
 		 792 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  38.07 
 
 		 753 aa  432  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 766 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 799 aa  365  1e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 814 aa  323  7e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 835 aa  242  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 768 aa  228  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 780 aa  226  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 796 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 762 aa  184  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 790 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 815 aa  159  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 782 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 772 aa  153  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 808 aa  153  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 786 aa  151  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  25.77 
 
 		 760 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  25.55 
 
 		 760 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 791 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 747 aa  133  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  23.2 
 
 		 740 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.37 
 
 		 766 aa  125  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 798 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 792 aa  119  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 768 aa  111  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 768 aa  111  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 746 aa  110  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 828 aa  109  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  24.78 
 
 		 734 aa  108  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 742 aa  107  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 781 aa  104  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 841 aa  99.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 782 aa  88.6  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 729 aa  85.5  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 736 aa  80.1  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 790 aa  75.5  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  25 
 
 		 740 aa  74.3  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 711 aa  74.3  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 754 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 754 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 786 aa  72  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 705 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 764 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.38 
 
 		 706 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  21.39 
 
 		 781 aa  70.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 756 aa  68.6  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 792 aa  67.4  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  27.75 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 732 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 755 aa  65.1  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 873 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 733 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  34.97 
 
 		 730 aa  64.7  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 694 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 721 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 683 aa  63.9  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 788 aa  62  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 726 aa  62  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 709 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 873 aa  61.6  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 831 aa  61.2  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.16 
 
 		 713 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.16 
 
 		 713 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 721 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 707 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  25.83 
 
 		 743 aa  60.8  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 707 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  23.15 
 
 		 703 aa  60.1  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.89 
 
 		 704 aa  60.1  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 739 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  28.12 
 
 		 710 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 		 809 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 683 aa  59.7  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 746 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 665 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 705 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 720 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 820 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  23.55 
 
 		 690 aa  58.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 833 aa  58.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 737 aa  58.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 697 aa  58.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 706 aa  58.2  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 710 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  23.68 
 
 		 729 aa  57.4  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 677 aa  57.4  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 799 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 696 aa  57  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 794 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 714 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>