154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1876 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 815 aa  1682    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 782 aa  428  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 786 aa  412  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 747 aa  339  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  32.62 
 
 		 760 aa  330  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  33.56 
 
 		 760 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 746 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 781 aa  242  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 798 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 828 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 841 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 729 aa  202  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 738 aa  200  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 738 aa  200  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.64 
 
 		 766 aa  180  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 736 aa  179  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 753 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 777 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 777 aa  174  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 766 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 796 aa  168  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  26.45 
 
 		 768 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 799 aa  165  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 768 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 780 aa  160  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 768 aa  160  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 747 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 772 aa  152  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 765 aa  147  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 792 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 814 aa  124  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 754 aa  109  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 754 aa  109  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 762 aa  105  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  22.88 
 
 		 740 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 791 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 772 aa  95.1  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  21.91 
 
 		 734 aa  94.7  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 835 aa  94  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 790 aa  82  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 782 aa  80.9  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 735 aa  77  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 790 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 735 aa  77  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  23.15 
 
 		 778 aa  77.4  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 778 aa  77.4  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  20.58 
 
 		 756 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 711 aa  75.1  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1207  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 786 aa  69.7  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  22.06 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  24.08 
 
 		 740 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  19.87 
 
 		 741 aa  69.3  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  27.01 
 
 		 693 aa  67.4  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  29.71 
 
 		 698 aa  64.7  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 774 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 792 aa  62.4  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  24.6 
 
 		 774 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  23.91 
 
 		 774 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  23.91 
 
 		 774 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  24.23 
 
 		 774 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 765 aa  60.8  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 774 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 687 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 774 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  24.29 
 
 		 782 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 782 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  28.85 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  28.85 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 781 aa  57.8  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.6 
 
 		 728 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 808 aa  57.4  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 768 aa  56.6  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 768 aa  56.6  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 		 709 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 705 aa  55.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  22.93 
 
 		 777 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 742 aa  55.1  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 742 aa  54.7  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 780 aa  54.3  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 736 aa  54.3  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 792 aa  54.3  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 696 aa  53.5  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 985 aa  53.9  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 782 aa  53.5  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 704 aa  53.9  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 791 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.13 
 
 		 724 aa  53.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  24.12 
 
 		 779 aa  52.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 679 aa  52.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 799 aa  52.4  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  25 
 
 		 784 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 628 aa  51.6  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 782 aa  50.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  26.49 
 
 		 771 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  22.26 
 
 		 740 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  25.5 
 
 		 784 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 784 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  23.81 
 
 		 942 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>