88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2061 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  100 
 
 
742 aa  1528    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 
756 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  33.61 
 
 
730 aa  405  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  32.41 
 
 
734 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  32.57 
 
 
740 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  32.48 
 
 
741 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  32.83 
 
 
740 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 
790 aa  324  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 
754 aa  295  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 
754 aa  295  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 
786 aa  293  6e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 
782 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 
736 aa  162  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 
729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 
777 aa  128  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  23.81 
 
 
768 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  23.57 
 
 
768 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 
738 aa  107  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 
738 aa  107  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 
746 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 
766 aa  101  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
285 aa  98.2  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 
747 aa  94.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 
765 aa  94.4  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 
772 aa  87.4  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  26.37 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  26.37 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 
780 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  21.3 
 
 
760 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  20.46 
 
 
760 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  20.68 
 
 
753 aa  72.4  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  22.83 
 
 
781 aa  71.6  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 
828 aa  70.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 
796 aa  70.5  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
792 aa  69.3  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 
768 aa  68.2  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  25 
 
 
747 aa  67  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 
799 aa  65.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 
777 aa  60.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
798 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  23.49 
 
 
744 aa  55.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 
829 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  20.06 
 
 
766 aa  54.3  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 
797 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 
815 aa  52.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 
841 aa  52.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 
782 aa  51.2  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  25.41 
 
 
747 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 
705 aa  50.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  25.41 
 
 
747 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 
803 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  25.84 
 
 
747 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  25.84 
 
 
745 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 
747 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  25.84 
 
 
747 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 
776 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  25.84 
 
 
747 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  25.84 
 
 
747 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 
798 aa  48.5  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 
779 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 
792 aa  48.5  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 
820 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 
786 aa  48.1  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 
767 aa  48.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  22.71 
 
 
792 aa  47.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  24.86 
 
 
752 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  23.51 
 
 
709 aa  47.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 
794 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  23.65 
 
 
695 aa  47.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 
762 aa  47.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 
714 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  22.37 
 
 
711 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 
712 aa  47  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 
828 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  23.08 
 
 
735 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  21.04 
 
 
713 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 
778 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 
782 aa  45.8  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  23.46 
 
 
797 aa  45.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  20.82 
 
 
720 aa  44.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 
740 aa  44.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 
793 aa  44.7  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 
734 aa  44.3  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 
769 aa  44.3  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  25.41 
 
 
747 aa  44.3  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 
790 aa  44.3  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 
705 aa  44.3  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 
837 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>