More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5156 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  100 
 
 
777 aa  1570    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  75.28 
 
 
788 aa  1141    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  68.84 
 
 
801 aa  1055    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  98.33 
 
 
777 aa  1546    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  98.33 
 
 
777 aa  1546    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  41.94 
 
 
778 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  39.92 
 
 
769 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 
822 aa  521  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  39.73 
 
 
741 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 
873 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  36.6 
 
 
741 aa  478  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  35.56 
 
 
873 aa  479  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  34.31 
 
 
797 aa  429  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 
813 aa  426  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 
779 aa  412  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 
824 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 
770 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 
773 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  31.63 
 
 
935 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 
802 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 
772 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  34.08 
 
 
787 aa  388  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 
841 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 
839 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 
839 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 
781 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  35.13 
 
 
848 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 
856 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 
821 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 
826 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 
825 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 
760 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 
825 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 
775 aa  375  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 
825 aa  376  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 
868 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 
807 aa  366  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 
805 aa  364  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
821 aa  318  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  40.93 
 
 
1188 aa  220  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  27.24 
 
 
775 aa  189  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  47.06 
 
 
317 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
688 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  23.57 
 
 
706 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  23.47 
 
 
710 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 
709 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 
742 aa  110  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 
720 aa  107  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 
726 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.87 
 
 
681 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.77 
 
 
706 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.9 
 
 
706 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.9 
 
 
706 aa  101  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.58 
 
 
727 aa  100  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.62 
 
 
706 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 
757 aa  98.6  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  22.49 
 
 
652 aa  97.4  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 
730 aa  97.4  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 
698 aa  97.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 
675 aa  96.3  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 
699 aa  95.5  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.42 
 
 
639 aa  95.5  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 
694 aa  94  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 
652 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 
705 aa  94  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 
715 aa  92.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 
697 aa  91.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  22.79 
 
 
653 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.65 
 
 
653 aa  89  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  22.93 
 
 
653 aa  88.6  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 
653 aa  88.2  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  22.79 
 
 
653 aa  88.2  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 
653 aa  88.2  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 
720 aa  87.4  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 
688 aa  87.4  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 
653 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 
742 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 
769 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  22.81 
 
 
703 aa  84.7  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 
733 aa  84.3  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 
678 aa  84  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 
778 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 
723 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 
705 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  23.67 
 
 
743 aa  82.4  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 
720 aa  82.4  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  26 
 
 
702 aa  80.9  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  29.49 
 
 
700 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 
700 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  25 
 
 
671 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 
705 aa  80.5  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  28.28 
 
 
711 aa  80.1  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 
728 aa  80.5  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  24.49 
 
 
757 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  29.49 
 
 
700 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 
705 aa  80.5  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 
702 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 
702 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 
700 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 
700 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>