More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2786 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  57.34 
 
 
657 aa  717    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  100 
 
 
644 aa  1298    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  58.32 
 
 
666 aa  725    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  48.03 
 
 
638 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 
688 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 
704 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 
704 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  29.91 
 
 
713 aa  207  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 
656 aa  157  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 
653 aa  150  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 
652 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  26.84 
 
 
656 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 
665 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 
653 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 
653 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 
653 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 
653 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.74 
 
 
653 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
653 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.45 
 
 
646 aa  139  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 
653 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  26.77 
 
 
659 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0118  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 
633 aa  102  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 
705 aa  100  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  22.85 
 
 
704 aa  98.6  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 
688 aa  98.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  24.6 
 
 
690 aa  97.8  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 
742 aa  97.4  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  24.01 
 
 
720 aa  95.1  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  27.69 
 
 
706 aa  94.4  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  34.85 
 
 
617 aa  93.6  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 
728 aa  92.8  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 
675 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 
693 aa  91.3  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 
715 aa  91.3  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  23.04 
 
 
708 aa  89.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 
675 aa  89.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  23.01 
 
 
696 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 
628 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  24.17 
 
 
664 aa  87.4  8e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 
720 aa  87  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  21.66 
 
 
774 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.84 
 
 
706 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 
792 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 
692 aa  86.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  33.84 
 
 
615 aa  86.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  24.15 
 
 
664 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 
721 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.93 
 
 
615 aa  85.5  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.24 
 
 
1023 aa  85.5  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  23.94 
 
 
618 aa  85.1  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.35 
 
 
713 aa  85.1  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.84 
 
 
706 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.21 
 
 
631 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.84 
 
 
706 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 
649 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 
746 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  21.5 
 
 
774 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40.38 
 
 
630 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  21.5 
 
 
774 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40.38 
 
 
630 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.52 
 
 
623 aa  83.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  21.5 
 
 
774 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.63 
 
 
614 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.47 
 
 
615 aa  83.2  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.92 
 
 
619 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  21.36 
 
 
774 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  38.64 
 
 
656 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.7 
 
 
706 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.69 
 
 
614 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.69 
 
 
614 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 
749 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.69 
 
 
614 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  23.42 
 
 
721 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.69 
 
 
614 aa  80.9  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.7 
 
 
721 aa  80.5  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  22.97 
 
 
731 aa  80.5  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 
728 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.58 
 
 
784 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  23.06 
 
 
688 aa  80.5  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 
705 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  22.89 
 
 
717 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 
649 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 
694 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 
641 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  38.62 
 
 
626 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 
686 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  38.62 
 
 
626 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.31 
 
 
614 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 
640 aa  78.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 
602 aa  78.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.43 
 
 
784 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  37.66 
 
 
614 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.66 
 
 
614 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 
679 aa  78.2  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.66 
 
 
614 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 
681 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.66 
 
 
614 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  25.15 
 
 
641 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  36.08 
 
 
628 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>