More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1430 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 738 aa  1504    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  49.01 
 
 		 849 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  39.72 
 
 		 812 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  38.9 
 
 		 816 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  38.9 
 
 		 813 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  39.54 
 
 		 843 aa  446  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  41.69 
 
 		 697 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  38.06 
 
 		 839 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  32.86 
 
 		 709 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  32.83 
 
 		 771 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 710 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 783 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  31.32 
 
 		 717 aa  300  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 758 aa  298  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  32.77 
 
 		 704 aa  293  8e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 751 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  32.1 
 
 		 713 aa  289  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 716 aa  281  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  30.32 
 
 		 721 aa  280  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  30.29 
 
 		 755 aa  277  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  32.24 
 
 		 724 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 700 aa  272  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  30.4 
 
 		 714 aa  266  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  30.8 
 
 		 732 aa  265  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 721 aa  262  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 723 aa  260  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 725 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 725 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 725 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 817 aa  257  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 718 aa  257  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 725 aa  257  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  30.45 
 
 		 733 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 701 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 739 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  27.86 
 
 		 723 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 701 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 723 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 723 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 809 aa  250  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 746 aa  250  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 726 aa  245  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 732 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 726 aa  243  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 726 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 704 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  29.57 
 
 		 713 aa  225  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  25.61 
 
 		 723 aa  221  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 808 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 817 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 764 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 742 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 808 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 753 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 698 aa  200  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 745 aa  188  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 745 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 745 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 716 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 728 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  33.02 
 
 		 332 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 698 aa  94  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 		 737 aa  90.1  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.62 
 
 		 750 aa  89.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  37.89 
 
 		 736 aa  89.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  23.17 
 
 		 712 aa  87.8  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.49 
 
 		 859 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 764 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 634 aa  83.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 742 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 679 aa  83.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 678 aa  83.2  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 699 aa  82.4  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 701 aa  82.4  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  38.19 
 
 		 613 aa  81.3  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  38.27 
 
 		 665 aa  81.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 634 aa  81.3  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.52 
 
 		 653 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 762 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 648 aa  79.7  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 634 aa  79  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.15 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.76 
 
 		 862 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 694 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 742 aa  77.8  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 664 aa  77.8  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  35.29 
 
 		 777 aa  77.8  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 722 aa  77.4  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  31.31 
 
 		 680 aa  77.8  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 686 aa  77  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 715 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 707 aa  77.4  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 697 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  31.54 
 
 		 617 aa  77  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 627 aa  76.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 649 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  30.96 
 
 		 618 aa  75.5  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 784 aa  74.7  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>