More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6547 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  48.31 
 
 
815 aa  727    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  50 
 
 
716 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  100 
 
 
791 aa  1622    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  45.19 
 
 
833 aa  684    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  49.68 
 
 
793 aa  764    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  43.42 
 
 
803 aa  608  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  41.5 
 
 
794 aa  530  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1311  TonB-dependent receptor  40.31 
 
 
720 aa  462  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5745  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 
691 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000026559  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  27.42 
 
 
914 aa  107  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 
958 aa  104  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  27.42 
 
 
942 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 
854 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  27.04 
 
 
871 aa  92  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  21.41 
 
 
828 aa  86.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 
828 aa  84.7  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 
791 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 
836 aa  81.3  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  27.62 
 
 
800 aa  78.2  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 
971 aa  78.2  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 
814 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 
791 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  21.06 
 
 
807 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 
787 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 
747 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 
798 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 
758 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  30 
 
 
998 aa  70.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 
759 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  26.42 
 
 
758 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
793 aa  68.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  27.43 
 
 
758 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 
721 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
735 aa  68.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 
1004 aa  68.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 
775 aa  67.4  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 
1001 aa  67.4  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
810 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 
790 aa  66.6  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 
1040 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 
818 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  25.21 
 
 
797 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
780 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
778 aa  65.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  26.78 
 
 
758 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 
1107 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 
726 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  27.05 
 
 
758 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 
1099 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 
922 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  22.09 
 
 
776 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  25.48 
 
 
788 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 
938 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 
918 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  22.1 
 
 
845 aa  64.7  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 
1102 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 
760 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 
1050 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  20.94 
 
 
760 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.59 
 
 
833 aa  62.4  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  25 
 
 
782 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 
772 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 
1066 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 
943 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 
882 aa  62.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  24.49 
 
 
848 aa  62  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 
792 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  25.31 
 
 
750 aa  62.4  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 
986 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  23.36 
 
 
918 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 
753 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 
991 aa  61.6  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 
1101 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 
1117 aa  61.6  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 
805 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 
1041 aa  61.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 
971 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 
1056 aa  60.8  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
835 aa  60.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 
807 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 
1008 aa  60.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25.63 
 
 
901 aa  60.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 
1028 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 
945 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 
933 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  23.89 
 
 
750 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 
1062 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 
710 aa  58.9  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 
1138 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 
1071 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  24.81 
 
 
799 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 
1066 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  26.83 
 
 
872 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
1063 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 
1051 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 
888 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 
1071 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 
957 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 
1089 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 
1020 aa  57.8  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>