47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1702 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  46.86 
 
 		 799 aa  699    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0295  TonB-dependent receptor  45.22 
 
 		 799 aa  641    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1702  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 787 aa  1592    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0960904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2040  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 787 aa  1592    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2935  TonB-dependent receptor  43.87 
 
 		 801 aa  621  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2551  TonB-dependent receptor  44.43 
 
 		 777 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0190132  normal  0.953315 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3609  TonB-dependent receptor  40.77 
 
 		 819 aa  545  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.396824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2552  TonB-dependent receptor  39.6 
 
 		 787 aa  505  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000691451  normal  0.635758 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2292  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 773 aa  386  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1937  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 773 aa  386  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00253489  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2936  hypothetical protein  40 
 
 		 550 aa  360  6e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0884836  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2288  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 776 aa  280  8e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1935  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 779 aa  280  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000527842  normal  0.699989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2940  TonB-dependent receptor domain protein  40.69 
 
 		 244 aa  156  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00105315  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 768 aa  99.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 768 aa  99.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 778 aa  73.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  24.58 
 
 		 778 aa  73.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 738 aa  67.4  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 738 aa  67.4  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 765 aa  64.7  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 777 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 782 aa  54.7  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  25.2 
 
 		 760 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 730 aa  52  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  20.48 
 
 		 730 aa  51.6  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  25.5 
 
 		 760 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 840 aa  51.2  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 754 aa  50.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 754 aa  50.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.44 
 
 		 806 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 702 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 759 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 733 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 765 aa  47.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 720 aa  46.6  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 708 aa  47  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 807 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.89 
 
 		 797 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 704 aa  46.2  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  25.77 
 
 		 693 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 853 aa  45.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 808 aa  45.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 708 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 711 aa  44.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  23.33 
 
 		 742 aa  44.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 705 aa  44.3  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>