More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2301 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  100 
 
 
706 aa  1454    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  40.88 
 
 
720 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  37.11 
 
 
726 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  38.51 
 
 
706 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  39 
 
 
709 aa  459  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  37.98 
 
 
715 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  37.55 
 
 
710 aa  459  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  38.9 
 
 
742 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  37.46 
 
 
700 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  37.32 
 
 
700 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  37.41 
 
 
700 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  37.32 
 
 
700 aa  445  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  37.41 
 
 
700 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  37.21 
 
 
728 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  37.46 
 
 
700 aa  445  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  37.41 
 
 
700 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  37.41 
 
 
700 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  38.44 
 
 
694 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 
700 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  36.75 
 
 
706 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  36.62 
 
 
706 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  36.62 
 
 
706 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  37.55 
 
 
721 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  37.55 
 
 
706 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 
681 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  38.05 
 
 
731 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  37.06 
 
 
705 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  35.46 
 
 
701 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  34.8 
 
 
743 aa  382  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.2 
 
 
712 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  37.65 
 
 
697 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 
723 aa  372  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 
736 aa  363  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 
675 aa  347  5e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 
688 aa  342  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 
723 aa  313  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 
705 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  30.61 
 
 
691 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 
678 aa  273  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 
680 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 
736 aa  156  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.16 
 
 
727 aa  151  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 
734 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 
742 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 
701 aa  143  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  23.22 
 
 
703 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 
726 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 
770 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
737 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 
715 aa  128  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 
717 aa  126  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  23.43 
 
 
762 aa  122  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 
706 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 
757 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 
713 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
780 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 
681 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 
698 aa  114  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  23.42 
 
 
712 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  23.89 
 
 
774 aa  112  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 
774 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  24.08 
 
 
774 aa  111  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 
678 aa  110  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  23.89 
 
 
774 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  23.89 
 
 
774 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 
714 aa  110  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 
690 aa  110  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 
733 aa  110  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 
700 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 
688 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
730 aa  109  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 
702 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 
716 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 
706 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 
706 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 
769 aa  105  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  20.54 
 
 
696 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  24.4 
 
 
695 aa  103  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  23.13 
 
 
782 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 
776 aa  100  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 
719 aa  100  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  20.14 
 
 
698 aa  100  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 
776 aa  100  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.76 
 
 
774 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 
718 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  20.85 
 
 
705 aa  99  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  23.49 
 
 
797 aa  99.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  23.61 
 
 
774 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  23.01 
 
 
617 aa  97.8  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 
757 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  22.59 
 
 
782 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  22.28 
 
 
736 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  21.87 
 
 
784 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  23.45 
 
 
809 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  23.15 
 
 
809 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  21.9 
 
 
784 aa  94  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  22.96 
 
 
809 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 
758 aa  93.2  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  23 
 
 
809 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  23.48 
 
 
788 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.805537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>