More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6779 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  44.35 
 
 		 824 aa  668    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  44.81 
 
 		 805 aa  676    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  82.18 
 
 		 821 aa  1372    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  61.05 
 
 		 868 aa  1026    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  82 
 
 		 825 aa  1373    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  64.64 
 
 		 856 aa  1094    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  95.88 
 
 		 826 aa  1560    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 825 aa  1660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  46.7 
 
 		 802 aa  697    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  66.55 
 
 		 848 aa  1120    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  82 
 
 		 825 aa  1374    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  42.87 
 
 		 807 aa  634  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  40.19 
 
 		 797 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  38.44 
 
 		 839 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  38.56 
 
 		 841 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 839 aa  515  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  35.59 
 
 		 775 aa  405  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 821 aa  389  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  34.02 
 
 		 741 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 769 aa  376  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  36.78 
 
 		 772 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 777 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 777 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 777 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 788 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 801 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 760 aa  357  6.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 773 aa  350  5e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 741 aa  349  9e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 778 aa  340  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 822 aa  338  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 781 aa  336  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 779 aa  330  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 873 aa  290  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 770 aa  290  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 873 aa  288  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 813 aa  273  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  29.11 
 
 		 935 aa  272  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  28.18 
 
 		 787 aa  271  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  27.68 
 
 		 775 aa  208  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 1188 aa  157  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  41.1 
 
 		 317 aa  126  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 728 aa  75.5  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 689 aa  67  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 675 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 688 aa  67  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.26 
 
 		 716 aa  64.7  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 726 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 702 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 702 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 706 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 709 aa  62.4  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.07 
 
 		 696 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 705 aa  62.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.56 
 
 		 696 aa  62.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 720 aa  62.4  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  26.02 
 
 		 778 aa  62  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 778 aa  62  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 778 aa  62  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.07 
 
 		 696 aa  61.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.07 
 
 		 696 aa  60.8  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.41 
 
 		 696 aa  60.8  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 694 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.05 
 
 		 688 aa  60.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  23.19 
 
 		 757 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 679 aa  60.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 702 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  24.41 
 
 		 697 aa  59.7  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.39 
 
 		 681 aa  59.7  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.57 
 
 		 712 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  23.19 
 
 		 709 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 717 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 714 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 688 aa  59.3  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 678 aa  59.3  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.47 
 
 		 695 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 731 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 692 aa  58.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 715 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  26.92 
 
 		 691 aa  58.2  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 766 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  30.06 
 
 		 713 aa  57  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 730 aa  57.4  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 757 aa  57.4  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 701 aa  56.2  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 700 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 703 aa  57  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 776 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.99 
 
 		 718 aa  56.6  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 776 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 719 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 706 aa  55.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.69 
 
 		 690 aa  56.2  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 700 aa  55.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 705 aa  55.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 697 aa  55.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  29.75 
 
 		 639 aa  55.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.07 
 
 		 696 aa  54.7  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 705 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>