More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1786 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  44.59 
 
 		 825 aa  663    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  44.17 
 
 		 826 aa  683    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  44.68 
 
 		 797 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  50.78 
 
 		 805 aa  812    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  45 
 
 		 825 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 824 aa  1685    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  44.35 
 
 		 868 aa  655    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  53.3 
 
 		 802 aa  818    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  44.78 
 
 		 848 aa  676    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  45.65 
 
 		 821 aa  692    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  44.51 
 
 		 856 aa  663    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  45 
 
 		 825 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  45.9 
 
 		 807 aa  688    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 839 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  37.26 
 
 		 839 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  37.26 
 
 		 841 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 775 aa  490  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 772 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  35.4 
 
 		 741 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 769 aa  445  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 821 aa  438  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 760 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  33.45 
 
 		 822 aa  428  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 779 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 778 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 741 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 788 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 773 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 781 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 873 aa  361  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 873 aa  354  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  29.87 
 
 		 787 aa  336  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 813 aa  330  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 770 aa  328  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  27.37 
 
 		 935 aa  301  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  28.4 
 
 		 775 aa  252  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 777 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 777 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 777 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 801 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 1188 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  41.49 
 
 		 317 aa  147  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 840 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 720 aa  78.2  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 688 aa  75.1  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 766 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 675 aa  74.3  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.88 
 
 		 727 aa  73.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 747 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 747 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 747 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 747 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 728 aa  70.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  24.27 
 
 		 715 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 747 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  23.27 
 
 		 748 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  22.64 
 
 		 772 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 634 aa  67.8  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 723 aa  67.8  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 718 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 702 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 702 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 748 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  22.64 
 
 		 748 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 748 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  23.31 
 
 		 746 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 706 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 709 aa  65.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  23.94 
 
 		 710 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  26.23 
 
 		 794 aa  65.1  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  23.95 
 
 		 692 aa  65.1  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2554  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 776 aa  65.1  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 726 aa  65.1  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 703 aa  64.7  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 714 aa  64.3  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 742 aa  64.7  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 681 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 821 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  23 
 
 		 720 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 688 aa  63.9  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 809 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 786 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 787 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  22.87 
 
 		 722 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 727 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.29 
 
 		 716 aa  63.5  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 694 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 724 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 730 aa  62  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 705 aa  61.6  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  25.16 
 
 		 745 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  22.33 
 
 		 749 aa  62  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 694 aa  61.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 738 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 678 aa  61.2  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 738 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 727 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 785 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  27.48 
 
 		 712 aa  60.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>