259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1926 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 779 aa  1602    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  57.36 
 
 		 773 aa  889    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  43.49 
 
 		 781 aa  630  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  37.71 
 
 		 741 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 		 778 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 769 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 788 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 741 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 824 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 839 aa  415  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 822 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 841 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 839 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 777 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 777 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 777 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 760 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 801 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 772 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  30.91 
 
 		 797 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 775 aa  346  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 873 aa  340  8e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 826 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 825 aa  335  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 825 aa  335  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  28.48 
 
 		 787 aa  333  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 821 aa  333  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 873 aa  331  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 805 aa  330  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 825 aa  330  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 848 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 868 aa  326  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 770 aa  325  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 813 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 856 aa  321  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 802 aa  318  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 821 aa  301  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  27.26 
 
 		 935 aa  297  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 807 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  40.15 
 
 		 1188 aa  223  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  47.46 
 
 		 317 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  22.22 
 
 		 775 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  21.2 
 
 		 688 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  21.4 
 
 		 706 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 700 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 700 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  26.24 
 
 		 700 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 700 aa  67  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 700 aa  67  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  26.24 
 
 		 700 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  24.21 
 
 		 710 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 706 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 700 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2258  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 708 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 694 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 705 aa  65.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 653 aa  65.1  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 709 aa  64.3  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 653 aa  63.9  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 653 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 652 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.08 
 
 		 706 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  25.08 
 
 		 721 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.72 
 
 		 726 aa  62.4  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 715 aa  62.4  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 634 aa  62.4  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  26.62 
 
 		 706 aa  62  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  27 
 
 		 706 aa  62  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 653 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 653 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.76 
 
 		 706 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 742 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 702 aa  61.6  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 		 702 aa  61.6  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 675 aa  61.2  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 737 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  22.5 
 
 		 723 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.61 
 
 		 653 aa  59.3  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 698 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 698 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 653 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 804 aa  58.9  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 698 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 686 aa  58.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  21.64 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  22.04 
 
 		 728 aa  58.2  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  28.47 
 
 		 713 aa  58.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  22.83 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 665 aa  57.8  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 704 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 681 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  21.56 
 
 		 709 aa  57  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 761 aa  57  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 678 aa  56.2  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>