121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2188 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 841 aa  1692    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  99.88 
 
 		 839 aa  1686    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  95.71 
 
 		 839 aa  1595    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  37.26 
 
 		 824 aa  544  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  41.92 
 
 		 772 aa  531  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  38.48 
 
 		 848 aa  528  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  36.91 
 
 		 797 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  38.5 
 
 		 826 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 856 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  38.85 
 
 		 825 aa  512  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  39.47 
 
 		 760 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  36.82 
 
 		 775 aa  504  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  36.65 
 
 		 802 aa  505  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  35.47 
 
 		 825 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  34.87 
 
 		 821 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  35.31 
 
 		 825 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  37.32 
 
 		 868 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  36.59 
 
 		 741 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 805 aa  490  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 821 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 807 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 769 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 773 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 779 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 778 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 822 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 741 aa  396  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 781 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 777 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 777 aa  376  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 777 aa  376  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 788 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 801 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 770 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 873 aa  310  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 873 aa  306  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  29.49 
 
 		 787 aa  278  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  28.72 
 
 		 935 aa  277  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 813 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  29.46 
 
 		 775 aa  255  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  36.21 
 
 		 1188 aa  194  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  41.52 
 
 		 317 aa  140  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 728 aa  76.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 705 aa  70.1  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 709 aa  67  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  27.74 
 
 		 706 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 715 aa  65.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  27.42 
 
 		 721 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  27.42 
 
 		 706 aa  64.7  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  27.42 
 
 		 706 aa  64.7  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  27.1 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 681 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  26.92 
 
 		 700 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  26.92 
 
 		 700 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 700 aa  62.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 700 aa  62.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 700 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 700 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 700 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 700 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 700 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 723 aa  57.8  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 742 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  24.28 
 
 		 691 aa  55.1  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  23.9 
 
 		 743 aa  54.7  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 678 aa  54.3  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 638 aa  54.3  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 706 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 675 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  29.52 
 
 		 710 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 785 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 688 aa  53.5  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 713 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 694 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 672 aa  52.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 808 aa  52  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.59 
 
 		 712 aa  52.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 		 728 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  21.91 
 
 		 708 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  27.36 
 
 		 713 aa  50.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  28.18 
 
 		 647 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 786 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 711 aa  49.3  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 705 aa  49.3  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 769 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 688 aa  48.9  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 618 aa  48.9  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 774 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.62 
 
 		 718 aa  48.5  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 703 aa  48.5  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 766 aa  48.5  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 776 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 710 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 776 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 648 aa  48.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.47 
 
 		 716 aa  48.5  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 736 aa  48.5  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>