198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2292 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  100 
 
 		 935 aa  1894    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  37.92 
 
 		 769 aa  538  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 741 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  34.96 
 
 		 787 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 822 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 778 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  41.55 
 
 		 1188 aa  406  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 777 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 777 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 777 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 813 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 801 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 788 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 770 aa  364  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  30.17 
 
 		 741 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 873 aa  328  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 873 aa  325  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 781 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  27.71 
 
 		 797 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 824 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 775 aa  297  6e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 779 aa  296  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 760 aa  293  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 773 aa  290  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 848 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 868 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 856 aa  282  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 826 aa  281  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 802 aa  281  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 839 aa  281  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 825 aa  281  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 825 aa  280  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 839 aa  277  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 841 aa  277  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 772 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 821 aa  273  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 825 aa  270  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 805 aa  265  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  54.39 
 
 		 317 aa  261  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 807 aa  243  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 821 aa  240  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  22.78 
 
 		 775 aa  116  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 720 aa  95.1  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 742 aa  94  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 		 694 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  20.91 
 
 		 706 aa  82  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  21.14 
 
 		 710 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  21.76 
 
 		 681 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  33.33 
 
 		 713 aa  74.3  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 705 aa  71.2  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 709 aa  70.1  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  26.35 
 
 		 659 aa  64.3  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 675 aa  64.3  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 647 aa  63.9  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 688 aa  63.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 701 aa  63.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 731 aa  62  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 723 aa  61.2  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  21.88 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  27.07 
 
 		 656 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.01 
 
 		 726 aa  59.3  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 715 aa  58.9  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  25.7 
 
 		 706 aa  58.2  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 688 aa  57.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 734 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 733 aa  55.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 748 aa  55.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 740 aa  55.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 723 aa  55.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 748 aa  55.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 757 aa  54.7  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  26.58 
 
 		 721 aa  54.7  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  26.58 
 
 		 706 aa  54.7  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.23 
 
 		 727 aa  54.7  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  26.58 
 
 		 706 aa  54.7  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  26.58 
 
 		 706 aa  54.3  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  25.62 
 
 		 715 aa  54.7  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 700 aa  54.7  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  26.58 
 
 		 706 aa  54.7  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 714 aa  54.3  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 700 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  20.58 
 
 		 706 aa  53.9  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 626 aa  53.9  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 613 aa  53.9  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.26 
 
 		 728 aa  53.9  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  25.96 
 
 		 700 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 679 aa  53.5  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  25.96 
 
 		 700 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 749 aa  53.5  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 700 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 726 aa  52.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 722 aa  52.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 700 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 700 aa  52.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 733 aa  52.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 700 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 700 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 835 aa  52.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 626 aa  52  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>