More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4265 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  74.37 
 
 		 856 aa  1315    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  64.73 
 
 		 825 aa  1019    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  66.06 
 
 		 848 aa  1155    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 868 aa  1740    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  61.49 
 
 		 821 aa  1039    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  61.03 
 
 		 826 aa  1026    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  45.37 
 
 		 805 aa  674    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  60.47 
 
 		 825 aa  1018    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  64.35 
 
 		 825 aa  1017    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  44.35 
 
 		 824 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  43.76 
 
 		 802 aa  646    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  43.99 
 
 		 807 aa  618  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  39.48 
 
 		 797 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  38.12 
 
 		 839 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  37.67 
 
 		 839 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  37.67 
 
 		 841 aa  498  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 775 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 769 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  34.89 
 
 		 821 aa  382  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.08 
 
 		 788 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  32.82 
 
 		 741 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 772 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 822 aa  363  9e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 801 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 760 aa  355  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 741 aa  335  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 778 aa  332  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 779 aa  326  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 781 aa  318  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 773 aa  312  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 873 aa  310  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 873 aa  304  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  27.69 
 
 		 935 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 813 aa  260  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  28.12 
 
 		 787 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 777 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 777 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 		 777 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 770 aa  220  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  27.16 
 
 		 775 aa  195  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 1188 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  37.58 
 
 		 317 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 778 aa  78.2  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  27.25 
 
 		 730 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 728 aa  74.3  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 749 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  22.89 
 
 		 714 aa  72  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  27.6 
 
 		 730 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 664 aa  70.1  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 675 aa  70.1  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 776 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  23.01 
 
 		 736 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 692 aa  68.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 		 717 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  24.76 
 
 		 784 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 		 710 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 700 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  22.99 
 
 		 732 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 776 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  20.75 
 
 		 694 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  22.79 
 
 		 738 aa  64.7  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  24.22 
 
 		 728 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  22.53 
 
 		 844 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.02 
 
 		 712 aa  63.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 692 aa  62.4  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 726 aa  62  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 707 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 707 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 709 aa  61.2  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  24.27 
 
 		 691 aa  61.2  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 717 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  26.2 
 
 		 721 aa  61.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 688 aa  60.8  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  26.2 
 
 		 706 aa  60.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  26.2 
 
 		 706 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 742 aa  60.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 792 aa  60.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  28.11 
 
 		 716 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  26.2 
 
 		 706 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  26.2 
 
 		 706 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 705 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  22.69 
 
 		 705 aa  60.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 719 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 711 aa  60.1  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 709 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 727 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  24.18 
 
 		 747 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  24.19 
 
 		 719 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 769 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  24.19 
 
 		 752 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 747 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  22.86 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  24.19 
 
 		 719 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  24.01 
 
 		 720 aa  58.9  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  22.86 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 747 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 747 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 704 aa  58.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>