283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7523 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 825 aa  1665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  46.73 
 
 		 805 aa  702    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  99.76 
 
 		 825 aa  1660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  65.84 
 
 		 856 aa  1110    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  60.7 
 
 		 868 aa  1021    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  66.47 
 
 		 848 aa  1127    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  82.39 
 
 		 826 aa  1384    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  47.61 
 
 		 802 aa  712    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  44.17 
 
 		 807 aa  643    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  45 
 
 		 824 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  82.25 
 
 		 825 aa  1361    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  94.79 
 
 		 821 aa  1548    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  40.07 
 
 		 797 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 839 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 841 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 		 839 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 821 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  33.21 
 
 		 741 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  36.83 
 
 		 772 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 769 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 775 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 777 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 777 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 777 aa  376  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 		 788 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 760 aa  363  7.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 778 aa  352  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 801 aa  350  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 741 aa  337  7.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 781 aa  336  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 779 aa  335  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 773 aa  332  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 822 aa  330  9e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 873 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 873 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 813 aa  281  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  28.64 
 
 		 935 aa  280  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  29.23 
 
 		 787 aa  278  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 770 aa  271  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  27.11 
 
 		 775 aa  203  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 1188 aa  151  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  43.21 
 
 		 317 aa  129  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 702 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 702 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 728 aa  73.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 688 aa  71.2  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 694 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 689 aa  69.7  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 709 aa  69.3  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 704 aa  68.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 675 aa  68.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 692 aa  67.4  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 720 aa  67.4  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 709 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  23.64 
 
 		 757 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  23.41 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 726 aa  61.6  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 717 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 702 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  25.82 
 
 		 697 aa  60.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.46 
 
 		 696 aa  60.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 706 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 715 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 688 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 778 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 719 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.88 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 679 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.88 
 
 		 696 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 771 aa  58.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.88 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.88 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.85 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.88 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.47 
 
 		 716 aa  58.5  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.09 
 
 		 712 aa  58.2  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.41 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  27.18 
 
 		 639 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 713 aa  57.8  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 681 aa  57  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24 
 
 		 696 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 727 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24 
 
 		 696 aa  57.4  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 742 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 720 aa  56.6  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 697 aa  56.6  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 705 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 738 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  23.31 
 
 		 747 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 738 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.98 
 
 		 695 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  22.89 
 
 		 745 aa  55.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  23.31 
 
 		 747 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 710 aa  55.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 736 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  23.31 
 
 		 747 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  21.48 
 
 		 692 aa  55.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 716 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 815 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 715 aa  54.7  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>