More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1787 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 813 aa  1658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  47.07 
 
 		 787 aa  697    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  44.36 
 
 		 770 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  38.36 
 
 		 741 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  35.55 
 
 		 769 aa  469  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 778 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 777 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 777 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 777 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 822 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 788 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  31.96 
 
 		 935 aa  405  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 801 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 873 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 873 aa  373  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  32.24 
 
 		 741 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 824 aa  349  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 779 aa  344  4e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 772 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 773 aa  337  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 802 aa  323  7e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 805 aa  318  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 781 aa  312  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 821 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 760 aa  306  7e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 825 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 825 aa  303  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 826 aa  300  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  30.97 
 
 		 797 aa  300  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 825 aa  292  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 775 aa  288  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 839 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 841 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 848 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 839 aa  283  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 868 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 856 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 821 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 807 aa  251  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  38.62 
 
 		 1188 aa  218  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  40.86 
 
 		 317 aa  160  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  21.71 
 
 		 775 aa  96.3  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 731 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 688 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 757 aa  72.8  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 742 aa  71.6  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 611 aa  70.5  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 782 aa  70.5  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 720 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 706 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  29.82 
 
 		 611 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 723 aa  67  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  27.62 
 
 		 666 aa  66.6  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 748 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 		 728 aa  65.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.03 
 
 		 712 aa  65.5  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 735 aa  65.1  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  23.7 
 
 		 652 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 747 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  25.16 
 
 		 747 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 634 aa  63.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 747 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 747 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 747 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  27.65 
 
 		 739 aa  62  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 694 aa  62  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 747 aa  62  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  26.48 
 
 		 772 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 723 aa  61.2  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  24.88 
 
 		 664 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 719 aa  60.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 753 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 821 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.75 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  23.89 
 
 		 810 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  26.48 
 
 		 748 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 748 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 748 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.75 
 
 		 706 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.75 
 
 		 706 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  26.64 
 
 		 659 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.75 
 
 		 721 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.75 
 
 		 706 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 698 aa  58.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 751 aa  58.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  25.38 
 
 		 732 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 812 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  30.28 
 
 		 692 aa  58.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.77 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 671 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 699 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 769 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  22.47 
 
 		 720 aa  57.4  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  25.9 
 
 		 663 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  22.01 
 
 		 727 aa  57  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 701 aa  56.2  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.9 
 
 		 663 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>