246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3150 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  52.4 
 
 		 802 aa  795    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  42.96 
 
 		 826 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  45.62 
 
 		 824 aa  692    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  43.09 
 
 		 848 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  43.37 
 
 		 825 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  43.39 
 
 		 821 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  43.37 
 
 		 825 aa  643    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 807 aa  1625    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  49.94 
 
 		 805 aa  793    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  43.33 
 
 		 825 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  43.22 
 
 		 856 aa  629  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  43.99 
 
 		 868 aa  618  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  40.35 
 
 		 797 aa  548  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  36.29 
 
 		 841 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 839 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  36.18 
 
 		 839 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  36.34 
 
 		 775 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 821 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  33.12 
 
 		 741 aa  369  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 760 aa  363  7.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 777 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 772 aa  363  8e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 777 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 777 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.62 
 
 		 788 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 769 aa  347  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 801 aa  333  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 778 aa  328  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 741 aa  325  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 781 aa  301  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 773 aa  299  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 822 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 779 aa  284  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 770 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 873 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 873 aa  263  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  27.59 
 
 		 787 aa  252  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  27.09 
 
 		 935 aa  244  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 813 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  26.96 
 
 		 775 aa  205  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 1188 aa  126  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  33.87 
 
 		 317 aa  111  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 700 aa  71.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 705 aa  69.7  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 711 aa  67.4  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 742 aa  66.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 731 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 728 aa  62  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 681 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 692 aa  61.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  23.59 
 
 		 716 aa  61.2  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.74 
 
 		 695 aa  60.8  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 694 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  29.22 
 
 		 715 aa  60.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 700 aa  60.1  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  29.03 
 
 		 727 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 720 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 726 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  21.42 
 
 		 782 aa  60.1  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.71 
 
 		 859 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 786 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 723 aa  59.3  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 716 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 689 aa  58.9  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 700 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  27.65 
 
 		 797 aa  58.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 702 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 702 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 698 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 709 aa  57.4  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  26.1 
 
 		 705 aa  57  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 700 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 700 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 785 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 700 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 778 aa  57  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  25.29 
 
 		 700 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 714 aa  56.6  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 681 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  24.05 
 
 		 697 aa  56.6  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 787 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  25.29 
 
 		 700 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  33.12 
 
 		 769 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3338  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.38 
 
 		 755 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.275973  decreased coverage  0.000566863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 649 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 715 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  23.1 
 
 		 857 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 664 aa  55.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.69 
 
 		 755 aa  55.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  33.33 
 
 		 767 aa  55.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 705 aa  55.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.4 
 
 		 706 aa  55.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 733 aa  55.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 791 aa  54.7  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.05 
 
 		 706 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  25 
 
 		 767 aa  54.7  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  31.88 
 
 		 767 aa  54.3  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  31.88 
 
 		 767 aa  54.3  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>