More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2714 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  46.07 
 
 		 802 aa  677    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  64.69 
 
 		 826 aa  1096    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  65.8 
 
 		 821 aa  1109    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  74.1 
 
 		 848 aa  1280    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  44.51 
 
 		 824 aa  663    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  65.72 
 
 		 825 aa  1097    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  46.11 
 
 		 805 aa  684    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  65.83 
 
 		 825 aa  1095    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 856 aa  1722    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  74.26 
 
 		 868 aa  1298    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  68.64 
 
 		 825 aa  1084    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  43.31 
 
 		 807 aa  623  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  38.54 
 
 		 797 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  37.09 
 
 		 841 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  37.59 
 
 		 839 aa  505  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  37.06 
 
 		 839 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 821 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 775 aa  399  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  34.21 
 
 		 741 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 769 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.02 
 
 		 788 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 777 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 777 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 777 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  34.47 
 
 		 772 aa  365  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 801 aa  360  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 822 aa  359  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 760 aa  353  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 773 aa  335  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 781 aa  334  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 741 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 778 aa  332  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 779 aa  321  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 873 aa  306  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 873 aa  297  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  27.76 
 
 		 935 aa  282  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  28.89 
 
 		 787 aa  279  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 770 aa  262  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 813 aa  258  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  26.93 
 
 		 775 aa  203  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 1188 aa  156  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  38.18 
 
 		 317 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 728 aa  78.2  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 776 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 776 aa  71.2  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 694 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 726 aa  68.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 675 aa  68.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 778 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  23.94 
 
 		 752 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  22.32 
 
 		 664 aa  66.6  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 688 aa  65.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  28.17 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  23.94 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  23.94 
 
 		 719 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 774 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 709 aa  63.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.43 
 
 		 727 aa  63.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 		 738 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 		 727 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 		 738 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 727 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 688 aa  62.4  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 719 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  32.02 
 
 		 639 aa  62  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 678 aa  62  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 745 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  23.23 
 
 		 747 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 731 aa  61.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 774 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 747 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 747 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 747 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.19 
 
 		 695 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  21.86 
 
 		 692 aa  60.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  22.99 
 
 		 840 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.79 
 
 		 696 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 705 aa  60.1  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 717 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  25.06 
 
 		 689 aa  59.3  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 747 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 692 aa  59.3  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.75 
 
 		 706 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.79 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.79 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 771 aa  58.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 747 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.75 
 
 		 706 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.75 
 
 		 706 aa  58.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.75 
 
 		 721 aa  58.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.75 
 
 		 706 aa  58.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.07 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  21.64 
 
 		 820 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 715 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>