More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0896 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 775 aa  1560    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  39.5 
 
 		 839 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  36.82 
 
 		 841 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  36.82 
 
 		 839 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 824 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  36.24 
 
 		 797 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  38.97 
 
 		 821 aa  478  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  35.18 
 
 		 805 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 		 802 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  38.17 
 
 		 772 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  38.24 
 
 		 760 aa  442  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  36.35 
 
 		 807 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  35.11 
 
 		 741 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 848 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 		 825 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 868 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 826 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 856 aa  399  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 821 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 825 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 825 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 777 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 769 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 777 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 777 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 822 aa  364  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 778 aa  363  8e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 801 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 741 aa  356  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 788 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 779 aa  346  8.999999999999999e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 773 aa  346  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 781 aa  325  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  30.09 
 
 		 787 aa  296  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  29.04 
 
 		 935 aa  293  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 770 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 873 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 813 aa  272  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 873 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  27.16 
 
 		 775 aa  205  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1188 aa  164  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  40.1 
 
 		 317 aa  144  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 733 aa  90.5  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.44 
 
 		 728 aa  87.4  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 731 aa  85.1  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 698 aa  84.3  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 688 aa  83.2  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 694 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 770 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 716 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 702 aa  77.8  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  29.17 
 
 		 779 aa  77.4  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 675 aa  71.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 709 aa  71.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  21.74 
 
 		 727 aa  70.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 700 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  27.04 
 
 		 647 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 720 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  22.34 
 
 		 710 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  28.52 
 
 		 697 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 761 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  22.88 
 
 		 706 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  22.88 
 
 		 706 aa  68.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  22.88 
 
 		 706 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.02 
 
 		 716 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 706 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 705 aa  68.2  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 713 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.15 
 
 		 696 aa  67.4  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 715 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.87 
 
 		 695 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 772 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  23.35 
 
 		 691 aa  66.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 717 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 772 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 757 aa  66.6  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.53 
 
 		 696 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.76 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  22.78 
 
 		 721 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  22.88 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.79 
 
 		 696 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 706 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.53 
 
 		 696 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.55 
 
 		 696 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 700 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 773 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  22.84 
 
 		 702 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  22.84 
 
 		 702 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 760 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 828 aa  62  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 700 aa  62  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 893 aa  61.6  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 723 aa  61.2  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 700 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 700 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 700 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 796 aa  60.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 782 aa  59.7  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  21.38 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>