162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02552 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  100 
 
 		 707 aa  1434    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  72.39 
 
 		 708 aa  1065    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  48.02 
 
 		 743 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  48.17 
 
 		 727 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  47.58 
 
 		 781 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  48.09 
 
 		 730 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  48.46 
 
 		 729 aa  595  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  45.93 
 
 		 781 aa  591  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4871  TonB-dependent receptor  44.91 
 
 		 757 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.782925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1456  TonB-dependent receptor  40.37 
 
 		 766 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.271102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3305  outer membrane insertion C-terminal signal  39.64 
 
 		 730 aa  485  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.256474  normal  0.926334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 749 aa  97.8  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 871 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  25.05 
 
 		 753 aa  70.5  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 698 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 923 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 639 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0959  TonB-dependent receptor  44.05 
 
 		 110 aa  60.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000367302  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  22.92 
 
 		 972 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  23.2 
 
 		 803 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 702 aa  58.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 684 aa  57.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  23.47 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 993 aa  57  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 671 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  27.98 
 
 		 656 aa  55.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 749 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 656 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  23.63 
 
 		 897 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  23.14 
 
 		 700 aa  54.3  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 650 aa  54.3  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 706 aa  54.3  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  22.91 
 
 		 917 aa  53.9  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  20.78 
 
 		 789 aa  53.9  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 793 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 699 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  26.23 
 
 		 663 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 663 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 799 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  28.12 
 
 		 650 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.93 
 
 		 650 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 705 aa  53.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 791 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  24.67 
 
 		 739 aa  52.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 713 aa  53.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  31.53 
 
 		 650 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 743 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  26.23 
 
 		 663 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  26.23 
 
 		 663 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  26.23 
 
 		 663 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 714 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  21.37 
 
 		 806 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  26.23 
 
 		 663 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 712 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 671 aa  53.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 779 aa  52.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  40.28 
 
 		 653 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  31.53 
 
 		 650 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  31.71 
 
 		 485 aa  52.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  31.53 
 
 		 650 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26.23 
 
 		 641 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 897 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  22.27 
 
 		 894 aa  52  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 710 aa  52  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 706 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  35.21 
 
 		 659 aa  52  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 966 aa  52  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 706 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  25.95 
 
 		 695 aa  51.6  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1596  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 366 aa  51.6  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  30.4 
 
 		 666 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 689 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  23.06 
 
 		 691 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  23.65 
 
 		 923 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  29.84 
 
 		 666 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  26.67 
 
 		 780 aa  50.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 635 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  26.88 
 
 		 715 aa  50.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  29.6 
 
 		 666 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  29.9 
 
 		 673 aa  49.3  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  29.6 
 
 		 666 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  29.6 
 
 		 666 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 719 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.3 
 
 		 728 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 773 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 713 aa  48.9  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  33.87 
 
 		 697 aa  49.3  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  24.1 
 
 		 847 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 772 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.16 
 
 		 698 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 645 aa  48.9  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 868 aa  48.5  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 706 aa  48.1  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 952 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 696 aa  48.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.82 
 
 		 656 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 698 aa  48.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 698 aa  48.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 698 aa  48.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 689 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>