102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3305 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3305  outer membrane insertion C-terminal signal  100 
 
 		 730 aa  1478    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.256474  normal  0.926334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4871  TonB-dependent receptor  59.97 
 
 		 757 aa  811    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.782925  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  44.49 
 
 		 781 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  44.94 
 
 		 781 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  41.46 
 
 		 743 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  41.31 
 
 		 727 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  41.69 
 
 		 729 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1456  TonB-dependent receptor  41.17 
 
 		 766 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.271102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  40.89 
 
 		 730 aa  505  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  41.16 
 
 		 708 aa  491  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  39.64 
 
 		 707 aa  484  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 749 aa  87.8  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 871 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  28.76 
 
 		 663 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  27.88 
 
 		 663 aa  57.4  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  23.08 
 
 		 737 aa  57  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0959  TonB-dependent receptor  42.05 
 
 		 110 aa  57.4  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000367302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 749 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 700 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  27.81 
 
 		 666 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  27.81 
 
 		 666 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  27.81 
 
 		 666 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  27.81 
 
 		 666 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  26.2 
 
 		 666 aa  54.3  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 		 748 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 		 748 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  21.24 
 
 		 690 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 689 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 698 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  35.62 
 
 		 673 aa  51.6  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  33.71 
 
 		 686 aa  51.6  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  35.79 
 
 		 572 aa  51.6  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 689 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 712 aa  51.6  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 705 aa  51.6  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 828 aa  51.2  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 738 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 		 740 aa  50.8  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  22.57 
 
 		 690 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 743 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 645 aa  49.7  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  25.14 
 
 		 1001 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  31.58 
 
 		 872 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  23.02 
 
 		 712 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0387  hypothetical protein  25.42 
 
 		 595 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0396  hypothetical protein  25.42 
 
 		 595 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.807659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  23.5 
 
 		 707 aa  48.9  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  23.01 
 
 		 742 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 740 aa  49.3  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 736 aa  48.9  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 737 aa  48.9  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.2 
 
 		 656 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  32.18 
 
 		 706 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  32.18 
 
 		 706 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 747 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  29.92 
 
 		 650 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  32.18 
 
 		 706 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 742 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 681 aa  48.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 709 aa  47.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 702 aa  47.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 747 aa  47.8  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 709 aa  47.4  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1596  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 366 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  29.7 
 
 		 656 aa  47.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  24.44 
 
 		 693 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 923 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  26.88 
 
 		 699 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  28.57 
 
 		 696 aa  46.2  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 701 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 806 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  29.13 
 
 		 650 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  29.13 
 
 		 650 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  29.13 
 
 		 650 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  29.13 
 
 		 650 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 806 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  30.23 
 
 		 697 aa  45.8  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  26.92 
 
 		 663 aa  45.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 812 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  22.3 
 
 		 714 aa  45.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2646  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 790 aa  45.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 679 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  30.39 
 
 		 663 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 663 aa  45.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  22.33 
 
 		 668 aa  45.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  30.39 
 
 		 663 aa  45.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  30.39 
 
 		 663 aa  45.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  30.39 
 
 		 663 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 742 aa  44.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  30.39 
 
 		 641 aa  44.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  30.39 
 
 		 659 aa  44.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 747 aa  44.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 790 aa  44.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 697 aa  44.7  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  28.67 
 
 		 780 aa  44.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 719 aa  44.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 712 aa  44.3  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.28 
 
 		 696 aa  44.3  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.28 
 
 		 696 aa  44.3  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 694 aa  44.3  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>