162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4401 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  39.52 
 
 		 917 aa  711    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  41.01 
 
 		 928 aa  738    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  54.51 
 
 		 923 aa  1074    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 923 aa  1900    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  37.94 
 
 		 791 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 793 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  36.94 
 
 		 786 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  37.02 
 
 		 803 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 790 aa  534  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  33.83 
 
 		 872 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  36.81 
 
 		 775 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  36.13 
 
 		 780 aa  520  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  36.65 
 
 		 787 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  36.98 
 
 		 775 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  36.15 
 
 		 814 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 		 772 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  34.27 
 
 		 800 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  35.45 
 
 		 800 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 881 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  33.29 
 
 		 792 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 791 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 806 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 789 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 804 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 874 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 875 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 852 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 772 aa  333  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 753 aa  314  5.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 756 aa  240  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 831 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  24.61 
 
 		 888 aa  197  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  24.24 
 
 		 866 aa  138  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  21.64 
 
 		 859 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  21.91 
 
 		 701 aa  102  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  24.81 
 
 		 802 aa  97.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  28.22 
 
 		 791 aa  96.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  20.55 
 
 		 814 aa  95.1  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  26.13 
 
 		 821 aa  87.4  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  21.61 
 
 		 797 aa  84.7  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 771 aa  82.8  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  22.2 
 
 		 779 aa  81.6  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.36 
 
 		 897 aa  81.6  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  25.29 
 
 		 822 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  28.52 
 
 		 821 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  21.79 
 
 		 777 aa  75.1  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  19.24 
 
 		 865 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  19.53 
 
 		 860 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  27.18 
 
 		 906 aa  72.4  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 897 aa  68.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  19.2 
 
 		 859 aa  68.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 708 aa  67.4  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  22.22 
 
 		 1127 aa  65.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  21.7 
 
 		 767 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 792 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.04 
 
 		 707 aa  62.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 800 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  20.73 
 
 		 836 aa  62.4  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  21.81 
 
 		 1139 aa  62.4  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 865 aa  62  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  21.33 
 
 		 1102 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 730 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  22.17 
 
 		 902 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 1142 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  23.6 
 
 		 1124 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  20.92 
 
 		 781 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 1192 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  21.02 
 
 		 1131 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  25.11 
 
 		 827 aa  57  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 935 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1062 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 759 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  21.77 
 
 		 1109 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  24.06 
 
 		 1116 aa  55.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  25.98 
 
 		 719 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  22.12 
 
 		 1102 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  20.78 
 
 		 1187 aa  54.3  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  21.86 
 
 		 1166 aa  54.3  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  22.08 
 
 		 1145 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 1090 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 760 aa  52.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 1169 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 924 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 1080 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 1144 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  20.88 
 
 		 1127 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3337  TonB-dependent receptor, plug  25.09 
 
 		 1119 aa  51.6  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.661419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1089 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  19.57 
 
 		 828 aa  51.2  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 747 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 828 aa  50.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 952 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  21.98 
 
 		 1150 aa  51.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  21.2 
 
 		 1139 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  31.58 
 
 		 848 aa  50.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  20.45 
 
 		 1148 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3882  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1027 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0857894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 917 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 991 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 998 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>