108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1991 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 749 aa  1541    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 871 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 781 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 781 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  24.84 
 
 		 729 aa  107  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 730 aa  100  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 727 aa  100  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 708 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1456  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 766 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.271102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.27 
 
 		 707 aa  97.4  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 743 aa  95.5  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3305  outer membrane insertion C-terminal signal  22.7 
 
 		 730 aa  87.8  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.256474  normal  0.926334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4871  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 757 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.782925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  26.79 
 
 		 1195 aa  75.1  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 1105 aa  68.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 1149 aa  67.4  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  22.27 
 
 		 747 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1167 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 776 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 785 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  27 
 
 		 1141 aa  64.3  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1162 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  28.46 
 
 		 1203 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1173 aa  62  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 1232 aa  62  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 988 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 1206 aa  61.2  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  25.32 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  21.86 
 
 		 1041 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  25.69 
 
 		 1210 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  26.45 
 
 		 972 aa  57.8  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 1176 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 1153 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1066 aa  57.4  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  21.07 
 
 		 795 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 760 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 938 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  25.51 
 
 		 1194 aa  55.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  26.15 
 
 		 822 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 888 aa  54.3  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1257 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1161 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1069 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 750 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  23.55 
 
 		 795 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 748 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  24.26 
 
 		 997 aa  53.5  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 1123 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 828 aa  52.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 817 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  27.44 
 
 		 1001 aa  52.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  29.32 
 
 		 767 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  23.75 
 
 		 979 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1132 aa  52.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 991 aa  52  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 1101 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  20.55 
 
 		 782 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  27 
 
 		 1067 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1109 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  21.77 
 
 		 1065 aa  51.6  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 1087 aa  51.6  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  27.87 
 
 		 1007 aa  51.2  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 1103 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  25 
 
 		 1196 aa  50.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  21.72 
 
 		 986 aa  51.2  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 1066 aa  50.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 1123 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 1188 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1122 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 737 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1071 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 783 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  22.36 
 
 		 779 aa  50.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 897 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  33.06 
 
 		 1194 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 798 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 789 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 797 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 1114 aa  48.5  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.34 
 
 		 1489 aa  48.5  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1053 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1075 aa  48.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.78 
 
 		 1710 aa  48.1  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 800 aa  48.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 805 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  24.16 
 
 		 1298 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  23.33 
 
 		 966 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  23.36 
 
 		 750 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 719 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1066 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  23.32 
 
 		 753 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 1105 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 993 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 806 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 791 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 1124 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 		 1113 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 625 aa  45.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  25.75 
 
 		 805 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  23.53 
 
 		 809 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>