12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0959 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0959  TonB-dependent receptor  100 
 
 
110 aa  222  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000367302  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  44.94 
 
 
730 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4871  TonB-dependent receptor  46.74 
 
 
757 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.782925  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  41.57 
 
 
727 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  41.57 
 
 
743 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  40.82 
 
 
729 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  44.05 
 
 
707 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3305  outer membrane insertion C-terminal signal  42.05 
 
 
730 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.256474  normal  0.926334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1456  TonB-dependent receptor  45.16 
 
 
766 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.271102  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  42.35 
 
 
781 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  42.35 
 
 
781 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 
708 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>