55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1456 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1456  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 766 aa  1557    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.271102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  44.82 
 
 		 781 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  44.08 
 
 		 781 aa  572  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  44.22 
 
 		 743 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4871  TonB-dependent receptor  43.94 
 
 		 757 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.782925  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  44.22 
 
 		 727 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  43.37 
 
 		 729 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  42.3 
 
 		 730 aa  535  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  42.59 
 
 		 708 aa  533  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  40.37 
 
 		 707 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3305  outer membrane insertion C-terminal signal  41.17 
 
 		 730 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.256474  normal  0.926334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 749 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 871 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 897 aa  64.7  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 966 aa  61.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0959  TonB-dependent receptor  45.16 
 
 		 110 aa  55.5  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000367302  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 777 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 777 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 777 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 714 aa  52  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 779 aa  50.8  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 788 aa  50.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 698 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  21.41 
 
 		 815 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  33.33 
 
 		 666 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  34.41 
 
 		 663 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 814 aa  48.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  33.33 
 
 		 666 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  33.33 
 
 		 666 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  33.33 
 
 		 666 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.97 
 
 		 666 aa  47.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1069 aa  47.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 743 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  24.68 
 
 		 680 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 		 828 aa  47.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 665 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 		 681 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 693 aa  47.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25.93 
 
 		 656 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  41.67 
 
 		 673 aa  46.2  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 708 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 897 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 726 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 801 aa  46.6  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  33.7 
 
 		 753 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  22.35 
 
 		 850 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 726 aa  45.8  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 		 702 aa  45.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  23.68 
 
 		 572 aa  45.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 868 aa  45.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  32.26 
 
 		 663 aa  44.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 698 aa  44.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 698 aa  44.7  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 698 aa  44.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 696 aa  44.3  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>