More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2819 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 897 aa  1833    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  42 
 
 		 888 aa  632  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 952 aa  481  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 935 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  44.08 
 
 		 1089 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 1087 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 966 aa  154  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  24.27 
 
 		 781 aa  124  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 753 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  30.74 
 
 		 1126 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1122 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1120 aa  106  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1066 aa  99.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 760 aa  98.6  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1109 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 806 aa  98.2  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 789 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  32.24 
 
 		 888 aa  94.4  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1054 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1196 aa  93.2  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 787 aa  91.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 777 aa  91.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  30.13 
 
 		 1194 aa  91.3  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 1114 aa  91.3  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 1004 aa  90.9  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  31.78 
 
 		 848 aa  90.1  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1147 aa  90.1  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  42.73 
 
 		 957 aa  89  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 747 aa  89.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 814 aa  88.2  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 760 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 814 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  32.31 
 
 		 1195 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 1149 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 828 aa  87  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1067 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 786 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 988 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1071 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1075 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1052 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 792 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 781 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1122 aa  82  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 753 aa  82  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1068 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 775 aa  82  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 924 aa  81.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  32.09 
 
 		 859 aa  81.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1074 aa  81.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 1176 aa  81.3  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 769 aa  80.9  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1125 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 759 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 861 aa  80.9  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 874 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 757 aa  79.3  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1013 aa  79.3  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 924 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 831 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  26.92 
 
 		 767 aa  78.2  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 1123 aa  78.2  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1023 aa  78.2  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 991 aa  77.4  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 1232 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 771 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 972 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  30.4 
 
 		 1041 aa  76.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 1105 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  28.15 
 
 		 1001 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  27.91 
 
 		 872 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 902 aa  75.5  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 927 aa  75.1  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 793 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 933 aa  75.1  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 875 aa  74.7  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 923 aa  74.7  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 801 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 845 aa  74.3  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 1188 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 962 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 818 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 991 aa  73.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 790 aa  73.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  28.1 
 
 		 986 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1051 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 881 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 772 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 779 aa  72.8  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 806 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  26.32 
 
 		 822 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1059 aa  72.4  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1066 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1028 aa  72  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 1123 aa  71.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 803 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1053 aa  71.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1075 aa  71.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  25.88 
 
 		 791 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 775 aa  71.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>