138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3841 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1123 aa  2285    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 1232 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  32.4 
 
 		 1196 aa  449  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1123 aa  358  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1075 aa  354  5.9999999999999994e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 1105 aa  353  7e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 1176 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 1153 aa  337  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1162 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1141 aa  318  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1161 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1125 aa  316  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 1149 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  27.02 
 
 		 1195 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1069 aa  300  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1167 aa  289  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1173 aa  286  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  27.03 
 
 		 1203 aa  284  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 1105 aa  278  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  26.6 
 
 		 1210 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 1114 aa  271  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 1124 aa  269  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 1065 aa  258  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  26 
 
 		 1194 aa  252  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 1206 aa  251  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1132 aa  245  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  26.22 
 
 		 1162 aa  244  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1122 aa  239  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1075 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1257 aa  218  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  32.31 
 
 		 511 aa  207  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  26.13 
 
 		 1298 aa  206  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1194 aa  164  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  32.46 
 
 		 986 aa  158  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1052 aa  156  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1053 aa  156  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1008 aa  149  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 1041 aa  148  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1066 aa  142  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1071 aa  135  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  22.32 
 
 		 966 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 1026 aa  132  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1097 aa  131  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  33 
 
 		 1067 aa  128  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1068 aa  127  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1100 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  23.42 
 
 		 1041 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  24.58 
 
 		 1056 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 1188 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  24.3 
 
 		 1081 aa  120  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1077 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  30.53 
 
 		 979 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  24.29 
 
 		 1125 aa  115  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 1008 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 1016 aa  110  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1074 aa  109  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 993 aa  108  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  30.56 
 
 		 992 aa  107  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  25.33 
 
 		 1061 aa  105  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1010 aa  105  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1074 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  29.84 
 
 		 1010 aa  101  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.61 
 
 		 1066 aa  99.8  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  22.86 
 
 		 710 aa  96.3  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  28.63 
 
 		 972 aa  94.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  27.22 
 
 		 1068 aa  93.6  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  30.26 
 
 		 1012 aa  90.9  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1105 aa  90.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 991 aa  89.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 1066 aa  85.9  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 888 aa  85.9  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1066 aa  85.5  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 1007 aa  84.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1126 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1120 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1122 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  24.62 
 
 		 1116 aa  82.8  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1071 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  24.41 
 
 		 1054 aa  79.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 897 aa  78.2  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1109 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 1007 aa  77  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  23.6 
 
 		 1008 aa  76.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 871 aa  75.1  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  26.06 
 
 		 1057 aa  74.7  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.14 
 
 		 1050 aa  72.8  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 790 aa  72.4  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  24.29 
 
 		 1037 aa  70.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  21.85 
 
 		 1001 aa  67.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 831 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1129 aa  65.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  25.75 
 
 		 1007 aa  64.3  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 753 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1008 aa  62.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  23.65 
 
 		 997 aa  62  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  23.4 
 
 		 994 aa  62.4  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  25.51 
 
 		 800 aa  61.6  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 1087 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  27.19 
 
 		 780 aa  58.9  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.18 
 
 		 1032 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>