152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3218 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  100 
 
 		 1075 aa  2179    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  37.95 
 
 		 1105 aa  599  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  33.65 
 
 		 1125 aa  512  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 1176 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 1123 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 1123 aa  357  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1069 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 1153 aa  310  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1161 aa  294  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 1149 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 1167 aa  283  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  26.78 
 
 		 1195 aa  281  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1162 aa  278  4e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 1065 aa  278  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1132 aa  269  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1141 aa  265  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 1114 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1173 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 1124 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  45.03 
 
 		 1232 aa  251  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1075 aa  248  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 1105 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1257 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  27.22 
 
 		 1203 aa  238  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 1041 aa  232  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1122 aa  227  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  25.86 
 
 		 986 aa  227  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  27.37 
 
 		 1194 aa  204  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  25.54 
 
 		 1162 aa  204  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  37.86 
 
 		 1196 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  41.03 
 
 		 511 aa  187  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  25.79 
 
 		 979 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  35.55 
 
 		 1210 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  34.33 
 
 		 1298 aa  164  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 		 1206 aa  161  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1068 aa  157  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  26.16 
 
 		 1125 aa  148  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  32.25 
 
 		 1071 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 1100 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1067 aa  135  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1008 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  25.31 
 
 		 1056 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1129 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1066 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 1188 aa  127  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 1008 aa  127  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1120 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1122 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1126 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  25 
 
 		 1068 aa  120  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1052 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1105 aa  119  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1053 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  22.88 
 
 		 1081 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 1026 aa  112  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1097 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  24.64 
 
 		 1116 aa  112  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  30.16 
 
 		 1010 aa  111  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  23.7 
 
 		 1061 aa  110  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1109 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1077 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  26.29 
 
 		 710 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  25.61 
 
 		 1041 aa  107  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1054 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  25.04 
 
 		 1057 aa  106  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  32.43 
 
 		 1066 aa  105  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 888 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1074 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1074 aa  102  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 1010 aa  99.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1071 aa  99.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  23.76 
 
 		 1008 aa  97.8  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  30.25 
 
 		 992 aa  96.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 991 aa  95.9  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1194 aa  95.9  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 1016 aa  95.1  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1066 aa  94.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  24.84 
 
 		 1051 aa  90.5  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 993 aa  89  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  25.08 
 
 		 972 aa  88.6  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  26.56 
 
 		 1001 aa  87  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  23.13 
 
 		 1037 aa  86.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.82 
 
 		 1050 aa  87  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 1066 aa  85.5  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 897 aa  82  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  25.69 
 
 		 994 aa  81.6  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  26.44 
 
 		 966 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 871 aa  78.6  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  25.94 
 
 		 1007 aa  77.4  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1007 aa  77.4  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 1007 aa  73.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  28.43 
 
 		 1012 aa  70.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 1089 aa  65.1  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  22.9 
 
 		 997 aa  63.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1008 aa  62.4  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 935 aa  61.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 865 aa  58.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 814 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 952 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 791 aa  55.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>