108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3840 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  100 
 
 		 1122 aa  2283    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 1114 aa  282  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1069 aa  263  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 1105 aa  263  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 1123 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 1206 aa  252  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 1149 aa  251  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 1065 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 1153 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1125 aa  243  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 1167 aa  238  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1075 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 1105 aa  230  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 1124 aa  217  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 1232 aa  216  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1196 aa  214  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1141 aa  207  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 1123 aa  206  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  26.13 
 
 		 1194 aa  195  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1132 aa  193  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  24.6 
 
 		 1210 aa  191  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1161 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  24.15 
 
 		 1203 aa  168  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1173 aa  161  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  31.49 
 
 		 986 aa  149  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  27.16 
 
 		 1298 aa  144  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  32.15 
 
 		 1075 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  30.46 
 
 		 1195 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  32.23 
 
 		 511 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1162 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  24.97 
 
 		 1068 aa  135  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1257 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  24.09 
 
 		 966 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 1176 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  25.34 
 
 		 1081 aa  126  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 1041 aa  126  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  26.28 
 
 		 979 aa  121  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  25.5 
 
 		 992 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1194 aa  119  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1008 aa  118  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 1097 aa  118  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.14 
 
 		 1008 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 1008 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  26.8 
 
 		 1066 aa  113  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  23.83 
 
 		 1051 aa  111  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1129 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 1100 aa  109  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  25.78 
 
 		 1041 aa  109  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1105 aa  107  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  27.78 
 
 		 1162 aa  106  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1071 aa  105  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  24.56 
 
 		 1010 aa  104  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  26.85 
 
 		 1125 aa  104  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  23.56 
 
 		 1057 aa  104  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 1188 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1067 aa  102  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1068 aa  101  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1077 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 1016 aa  97.4  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  23.39 
 
 		 1056 aa  95.1  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1066 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1052 aa  91.3  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1053 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  30.22 
 
 		 972 aa  87.8  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  28.91 
 
 		 1116 aa  86.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 991 aa  85.5  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1074 aa  85.1  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  24.76 
 
 		 1012 aa  82.4  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 897 aa  82  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1074 aa  81.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 888 aa  78.2  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1120 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1122 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1071 aa  77  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 1066 aa  75.5  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1126 aa  74.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  26.55 
 
 		 1061 aa  74.3  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1109 aa  74.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 952 aa  72.4  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  26.9 
 
 		 997 aa  72.4  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  24.01 
 
 		 710 aa  72.4  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  24.13 
 
 		 994 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  23 
 
 		 1001 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 993 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1007 aa  69.7  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 1026 aa  69.3  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1066 aa  68.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 1007 aa  67  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 871 aa  65.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  28.06 
 
 		 1037 aa  63.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.31 
 
 		 1050 aa  62.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 791 aa  58.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 779 aa  57.8  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1008 aa  56.6  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 749 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  37.23 
 
 		 1007 aa  54.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 781 aa  53.5  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 1010 aa  53.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 1054 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  26.46 
 
 		 822 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>