153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0659 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  100 
 
 		 888 aa  1767    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 874 aa  288  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 792 aa  264  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 753 aa  259  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 806 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 875 aa  248  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 804 aa  245  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  25.28 
 
 		 872 aa  232  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 775 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  26.58 
 
 		 780 aa  231  4e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 775 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 772 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 881 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 790 aa  223  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 814 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 800 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 789 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 772 aa  211  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  26.06 
 
 		 800 aa  211  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 793 aa  210  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 831 aa  208  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 787 aa  201  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 791 aa  200  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 923 aa  197  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 923 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 852 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 791 aa  167  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 803 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 786 aa  162  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  23.27 
 
 		 917 aa  154  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  28.04 
 
 		 866 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 902 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  21.7 
 
 		 928 aa  146  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  22 
 
 		 756 aa  131  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  25.5 
 
 		 859 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  25.5 
 
 		 860 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  25.71 
 
 		 865 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 897 aa  94.7  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 897 aa  94  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  25.66 
 
 		 859 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 814 aa  87  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  21.08 
 
 		 701 aa  83.2  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  22.94 
 
 		 906 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1147 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 777 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 865 aa  74.7  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1173 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 1089 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 730 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 800 aa  72.4  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  23.8 
 
 		 779 aa  72.8  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 888 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  22.18 
 
 		 822 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  20.98 
 
 		 771 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1092 aa  67.8  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1093 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 935 aa  65.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  27.56 
 
 		 719 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  24.73 
 
 		 767 aa  65.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  27.1 
 
 		 802 aa  64.7  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 797 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 727 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  23.63 
 
 		 1101 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 1004 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 743 aa  59.7  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 781 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1188 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 1175 aa  58.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  22.83 
 
 		 972 aa  57.8  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  22.16 
 
 		 791 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1066 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  26.89 
 
 		 827 aa  55.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0287  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  23 
 
 		 714 aa  55.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000460019  hitchhiker  0.00000346512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 1080 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 830 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 792 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 		 716 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  20.83 
 
 		 821 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  37.23 
 
 		 957 aa  54.7  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  22.22 
 
 		 729 aa  54.3  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  44.26 
 
 		 1087 aa  54.3  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  23 
 
 		 821 aa  53.9  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 1166 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  43.94 
 
 		 818 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 966 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  29.82 
 
 		 799 aa  53.5  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  22.67 
 
 		 1161 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 1144 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 952 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 1001 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 791 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 793 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 919 aa  52.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  21.95 
 
 		 1116 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 1144 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1102 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1116 aa  51.2  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 836 aa  50.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 801 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  40.59 
 
 		 893 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>