107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0315 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  100 
 
 		 1125 aa  2314    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 1105 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1075 aa  488  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 1123 aa  366  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 1176 aa  343  9e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1069 aa  331  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 1153 aa  327  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 1123 aa  316  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 1149 aa  316  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 1232 aa  307  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 1167 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1173 aa  282  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  25.97 
 
 		 1203 aa  273  9e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1141 aa  271  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1196 aa  268  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 1206 aa  262  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  26.28 
 
 		 1194 aa  258  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 1124 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 1041 aa  252  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 1065 aa  251  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1075 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1162 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1122 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1257 aa  222  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 1105 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  24.27 
 
 		 986 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 1114 aa  211  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  24.63 
 
 		 1162 aa  198  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  26.82 
 
 		 1195 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  35.19 
 
 		 1210 aa  164  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1132 aa  164  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  34.82 
 
 		 1298 aa  160  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  35.02 
 
 		 511 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1161 aa  157  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1194 aa  149  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1052 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1129 aa  142  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  25.56 
 
 		 1125 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  23.49 
 
 		 1097 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  26.01 
 
 		 710 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  23.82 
 
 		 966 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  23.54 
 
 		 1041 aa  132  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  26.61 
 
 		 1056 aa  131  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 1188 aa  130  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1067 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  25.79 
 
 		 979 aa  128  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 1074 aa  128  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  24.21 
 
 		 1068 aa  127  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1077 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  25 
 
 		 1071 aa  124  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  24.74 
 
 		 1081 aa  124  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1105 aa  120  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  23.6 
 
 		 1051 aa  117  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 1100 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  24.29 
 
 		 992 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1008 aa  115  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1053 aa  115  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  24.89 
 
 		 1061 aa  111  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.08 
 
 		 1066 aa  110  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  23.97 
 
 		 1116 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1068 aa  111  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1109 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  24.22 
 
 		 1010 aa  109  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1074 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 1010 aa  103  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 1008 aa  100  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1126 aa  98.6  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1120 aa  99  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1122 aa  99  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.05 
 
 		 1008 aa  97.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1066 aa  97.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1071 aa  95.9  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 1026 aa  94.7  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 1016 aa  94.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  23.79 
 
 		 1057 aa  91.3  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  26.61 
 
 		 972 aa  88.2  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 991 aa  85.1  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  23.67 
 
 		 1012 aa  85.1  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  26.77 
 
 		 994 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 993 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1066 aa  80.1  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1054 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  26.52 
 
 		 997 aa  79  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 897 aa  79  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  26.84 
 
 		 1001 aa  75.1  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 1007 aa  73.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1007 aa  68.6  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 871 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  25.29 
 
 		 1037 aa  67  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.73 
 
 		 1050 aa  66.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 888 aa  66.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1008 aa  63.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 952 aa  62.4  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  25.51 
 
 		 799 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  23.8 
 
 		 485 aa  53.5  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  21.38 
 
 		 1066 aa  52.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 798 aa  52.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 1089 aa  51.6  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 1087 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  25.2 
 
 		 915 aa  49.3  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>