More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6201 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  41.51 
 
 		 775 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 792 aa  1639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  44.77 
 
 		 790 aa  687    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  45.01 
 
 		 793 aa  703    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  48.2 
 
 		 814 aa  755    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  41.66 
 
 		 881 aa  651    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  50.25 
 
 		 787 aa  785    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  42.75 
 
 		 772 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  39.95 
 
 		 775 aa  619  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  41.28 
 
 		 791 aa  622  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  40.2 
 
 		 780 aa  603  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  40.2 
 
 		 872 aa  588  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  38.92 
 
 		 800 aa  569  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  37.32 
 
 		 923 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 		 791 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  35.43 
 
 		 806 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 803 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  35.32 
 
 		 789 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  35.15 
 
 		 804 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 923 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  33.38 
 
 		 917 aa  462  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 800 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  33.29 
 
 		 928 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 875 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 772 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 874 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  33.25 
 
 		 786 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 852 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 753 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  27.33 
 
 		 888 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 756 aa  251  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 831 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  23.03 
 
 		 866 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.21 
 
 		 859 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 797 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 814 aa  105  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 779 aa  101  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  27.41 
 
 		 822 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  34.73 
 
 		 827 aa  97.8  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  21.61 
 
 		 865 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  26.53 
 
 		 821 aa  95.5  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 792 aa  94.4  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  26.07 
 
 		 767 aa  91.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  25.58 
 
 		 906 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  19.6 
 
 		 701 aa  87.8  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 771 aa  85.5  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  30.74 
 
 		 821 aa  84.7  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  21.12 
 
 		 902 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 897 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  24.48 
 
 		 791 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  30.2 
 
 		 1095 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  21.13 
 
 		 860 aa  82  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  20.58 
 
 		 859 aa  80.9  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  29.71 
 
 		 719 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1079 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 935 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  25.52 
 
 		 802 aa  79  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1062 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 800 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 979 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 986 aa  78.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1148 aa  77.4  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1006 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 982 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 865 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 933 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1100 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  22.75 
 
 		 897 aa  75.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 986 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 924 aa  74.7  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1057 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1173 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 1050 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1147 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1147 aa  72  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1023 aa  72  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1181 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1188 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  26.29 
 
 		 1051 aa  71.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1060 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 943 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1117 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 1137 aa  70.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  23.33 
 
 		 777 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1027 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 962 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1104 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  35.82 
 
 		 998 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1028 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 730 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1101 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1087 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1095 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1105 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1056 aa  68.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 760 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  30 
 
 		 856 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 1087 aa  68.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 887 aa  68.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 994 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>