154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1696 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  100 
 
 
756 aa  1541    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 
772 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 
775 aa  355  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  31.67 
 
 
800 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 
789 aa  341  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 
806 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 
881 aa  323  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 
804 aa  306  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 
775 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 
787 aa  296  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 
772 aa  295  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 
874 aa  294  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
791 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  29.3 
 
 
780 aa  290  8e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
790 aa  284  5.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 
793 aa  280  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 
814 aa  277  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 
875 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 
791 aa  259  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 
923 aa  253  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  26.58 
 
 
872 aa  253  9.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 
928 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  28.34 
 
 
917 aa  249  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 
800 aa  248  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 
792 aa  241  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 
923 aa  240  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 
786 aa  231  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 
753 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 
852 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  23.49 
 
 
803 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  22 
 
 
888 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  22.39 
 
 
866 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 
831 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  21.29 
 
 
859 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  25.86 
 
 
821 aa  78.6  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  19.08 
 
 
865 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  19.13 
 
 
860 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  21.36 
 
 
906 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 
1082 aa  67.8  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2226  hypothetical protein  23.65 
 
 
740 aa  66.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000689812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 
996 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  26.76 
 
 
914 aa  65.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  26.74 
 
 
802 aa  64.7  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  20.47 
 
 
701 aa  62.4  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  28.51 
 
 
808 aa  62  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 
1059 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 
1070 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 
792 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 
1085 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 
1137 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  23.12 
 
 
716 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 
1148 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 
994 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 
865 aa  57.4  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 
730 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  21.51 
 
 
821 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 
1062 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 
1102 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 
1059 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 
1043 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  25.39 
 
 
719 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 
1077 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 
987 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  27.67 
 
 
750 aa  54.7  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  26.83 
 
 
1032 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 
1148 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  21.26 
 
 
859 aa  54.3  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 
1029 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 
1063 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 
1148 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  25 
 
 
791 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 
1096 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  26.42 
 
 
1007 aa  51.2  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  27.49 
 
 
1043 aa  50.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  22.43 
 
 
1142 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 
1202 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 
1168 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  23.63 
 
 
814 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 
1014 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 
1023 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 
982 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 
733 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 
1064 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 
1155 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 
1055 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 
1146 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 
1076 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 
996 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  26.02 
 
 
1017 aa  49.3  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 
767 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 
1038 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  24.47 
 
 
1018 aa  49.3  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 
1021 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  23.85 
 
 
1072 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 
1010 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 
1028 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 
1056 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 
1117 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 
1010 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 
1102 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>