More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4916 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 719 aa  1458    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  36.81 
 
 		 716 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  37.59 
 
 		 730 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_002950  PG2226  hypothetical protein  29.29 
 
 		 740 aa  266  8.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000689812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 775 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  23.88 
 
 		 779 aa  91.7  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 793 aa  86.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  22.43 
 
 		 906 aa  84  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  22.8 
 
 		 872 aa  80.9  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  26.81 
 
 		 827 aa  78.2  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 753 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  21.8 
 
 		 859 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  23.61 
 
 		 789 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 792 aa  73.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 988 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  21.33 
 
 		 865 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  23.09 
 
 		 771 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  23.13 
 
 		 772 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  21.42 
 
 		 800 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 792 aa  68.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  22.55 
 
 		 800 aa  68.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 1175 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 787 aa  67.4  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  21.95 
 
 		 803 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 897 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 874 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 806 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 814 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  27.56 
 
 		 888 aa  65.1  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 753 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 791 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  23.87 
 
 		 902 aa  64.7  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1008 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1077 aa  64.7  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1013 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  23.46 
 
 		 923 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  36.59 
 
 		 1186 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  37.14 
 
 		 996 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  21.85 
 
 		 874 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  21.19 
 
 		 860 aa  60.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 866 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 1008 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1127 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1047 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 772 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  27.08 
 
 		 767 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  24 
 
 		 799 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1006 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1143 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 1089 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  37.04 
 
 		 829 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  29.12 
 
 		 993 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 763 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  28.49 
 
 		 788 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1094 aa  58.9  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1021 aa  58.9  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 881 aa  58.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1059 aa  58.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 1140 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 791 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 873 aa  58.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  23.58 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1024 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1155 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  29.6 
 
 		 828 aa  57.8  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 1083 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  26.48 
 
 		 859 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 776 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  33.83 
 
 		 1102 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1192 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 998 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1070 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 791 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1074 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1107 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 971 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.08 
 
 		 631 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1116 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1103 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 1045 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1066 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 804 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 943 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 1063 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 756 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  24.57 
 
 		 821 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 775 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1043 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1042 aa  54.7  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1022 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1046 aa  54.7  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 1080 aa  54.3  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1079 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  35.79 
 
 		 1132 aa  54.3  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 923 aa  53.9  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 1059 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 735 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1119 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1146 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 1130 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>