122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1227 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  39.98 
 
 		 917 aa  729    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  41.77 
 
 		 928 aa  737    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 923 aa  1892    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  54.51 
 
 		 923 aa  1074    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  40.23 
 
 		 803 aa  594  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  39.13 
 
 		 793 aa  572  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  38.15 
 
 		 775 aa  568  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  39.05 
 
 		 787 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  38.8 
 
 		 775 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  37.37 
 
 		 814 aa  552  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  38.67 
 
 		 772 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  38.48 
 
 		 786 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  38.12 
 
 		 800 aa  540  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 881 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  37.66 
 
 		 790 aa  537  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  37.53 
 
 		 780 aa  529  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  37.32 
 
 		 792 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  37.28 
 
 		 791 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  37.32 
 
 		 872 aa  515  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 800 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 791 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  34.27 
 
 		 789 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 		 806 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  34.99 
 
 		 804 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 875 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 874 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 852 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 753 aa  354  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 772 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 756 aa  253  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 831 aa  200  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  24.3 
 
 		 888 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 		 814 aa  125  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  22.76 
 
 		 866 aa  115  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  26.19 
 
 		 802 aa  102  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  26.29 
 
 		 791 aa  89.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  23.72 
 
 		 771 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  25.3 
 
 		 822 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  26.23 
 
 		 821 aa  81.3  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  19.42 
 
 		 860 aa  77  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  24.76 
 
 		 906 aa  75.5  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  23.38 
 
 		 767 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 897 aa  74.7  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  25.9 
 
 		 821 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 779 aa  73.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  19.9 
 
 		 902 aa  72.8  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  19.68 
 
 		 865 aa  71.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  19.13 
 
 		 859 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 		 797 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  25 
 
 		 859 aa  65.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 701 aa  63.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 730 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 760 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 828 aa  62.4  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  22.32 
 
 		 777 aa  61.2  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  27.35 
 
 		 719 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  25.33 
 
 		 827 aa  59.7  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 800 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  22.93 
 
 		 1127 aa  59.7  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  22.38 
 
 		 1147 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  20.94 
 
 		 1148 aa  58.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 935 aa  57.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 792 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 763 aa  57.4  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1085 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  22.03 
 
 		 1129 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  21.49 
 
 		 1145 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  23.55 
 
 		 605 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  23.8 
 
 		 1147 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 708 aa  53.5  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1081 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 865 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 1090 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  20.47 
 
 		 1102 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  23.95 
 
 		 962 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  23.36 
 
 		 1148 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 952 aa  52.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.43 
 
 		 848 aa  51.6  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 1089 aa  52  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 716 aa  51.2  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.65 
 
 		 707 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  21.75 
 
 		 1192 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  21.93 
 
 		 1154 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 998 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  21.37 
 
 		 966 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1022 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1117 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1071 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 735 aa  48.5  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  21.73 
 
 		 1122 aa  48.5  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 917 aa  48.5  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 833 aa  48.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  21.7 
 
 		 1139 aa  48.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1096 aa  48.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  21.69 
 
 		 1177 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 1051 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 993 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  20.35 
 
 		 747 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 791 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 996 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>