84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2533 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 800 aa  1625    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  40.72 
 
 		 797 aa  552  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  39.12 
 
 		 771 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  38.43 
 
 		 791 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  35.87 
 
 		 779 aa  463  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  35.44 
 
 		 822 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 777 aa  435  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  30.38 
 
 		 767 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  23.49 
 
 		 874 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 772 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  22.76 
 
 		 753 aa  104  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  22.08 
 
 		 865 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.64 
 
 		 859 aa  98.6  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  20.63 
 
 		 860 aa  88.2  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  20.76 
 
 		 859 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  22.5 
 
 		 806 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  22.58 
 
 		 831 aa  81.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.17 
 
 		 897 aa  80.9  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  21.36 
 
 		 701 aa  78.6  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  26.82 
 
 		 800 aa  78.2  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  21.23 
 
 		 906 aa  77.4  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  20.97 
 
 		 804 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 852 aa  74.3  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  22.14 
 
 		 789 aa  73.9  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  22.11 
 
 		 792 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  22.21 
 
 		 888 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 772 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  20.19 
 
 		 814 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  21.7 
 
 		 775 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 935 aa  65.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 787 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 872 aa  64.3  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0287  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  20.81 
 
 		 714 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000460019  hitchhiker  0.00000346512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 791 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 923 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 875 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 881 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 775 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 923 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  20.81 
 
 		 866 aa  58.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  39.45 
 
 		 847 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  27.31 
 
 		 917 aa  55.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  35.79 
 
 		 962 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1109 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 897 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 962 aa  54.3  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 1089 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1147 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  23.7 
 
 		 780 aa  53.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  23.53 
 
 		 928 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  20.45 
 
 		 814 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 933 aa  51.2  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 790 aa  50.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1059 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 730 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  20.29 
 
 		 719 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 865 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  24.2 
 
 		 827 aa  48.5  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 791 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  21.43 
 
 		 716 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 776 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 800 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 938 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  23.18 
 
 		 803 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 757 aa  46.2  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  22.97 
 
 		 821 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 993 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1014 aa  45.8  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  22.85 
 
 		 802 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 828 aa  45.4  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 804 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  28.9 
 
 		 1047 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1075 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 957 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 798 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 805 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.07 
 
 		 1489 aa  45.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 931 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.15 
 
 		 1041 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 750 aa  44.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 893 aa  44.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1001 aa  44.3  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 1087 aa  44.3  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 929 aa  44.3  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>