85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4145 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 865 aa  1715    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  33.12 
 
 		 859 aa  327  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  33.03 
 
 		 865 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  30.14 
 
 		 906 aa  287  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  31.52 
 
 		 860 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  30.7 
 
 		 859 aa  256  9e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  23.34 
 
 		 772 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  24.97 
 
 		 897 aa  117  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 789 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 701 aa  116  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  22.58 
 
 		 831 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0287  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  22.81 
 
 		 714 aa  112  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000460019  hitchhiker  0.00000346512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  22.07 
 
 		 775 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  22.31 
 
 		 775 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  21.57 
 
 		 780 aa  102  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  21.67 
 
 		 875 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  22.81 
 
 		 753 aa  98.2  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  22.28 
 
 		 804 aa  91.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  22.55 
 
 		 874 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  25.56 
 
 		 800 aa  83.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 792 aa  81.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  22 
 
 		 791 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 881 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 806 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  23.32 
 
 		 777 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  23.57 
 
 		 888 aa  74.7  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 771 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 793 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 791 aa  71.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 952 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  27.84 
 
 		 866 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 923 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  27.32 
 
 		 928 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 787 aa  66.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  30.82 
 
 		 872 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 790 aa  64.7  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 1089 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 791 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  29.24 
 
 		 917 aa  63.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 779 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 814 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  21.67 
 
 		 772 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 814 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1075 aa  58.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1109 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 756 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  22.12 
 
 		 923 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 935 aa  57.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 966 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 		 1007 aa  56.2  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 786 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 888 aa  55.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1122 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1120 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 800 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1126 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 991 aa  54.3  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1087 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 993 aa  52  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 852 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 1086 aa  51.2  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 800 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 902 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 781 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 1232 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 778 aa  48.9  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  21.98 
 
 		 1066 aa  48.9  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 803 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 897 aa  48.5  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  22.95 
 
 		 833 aa  48.5  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1069 aa  48.5  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1054 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  25.2 
 
 		 992 aa  48.1  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 801 aa  48.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1033 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  38.27 
 
 		 680 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 1004 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 918 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  22.35 
 
 		 767 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  25.68 
 
 		 719 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  23.04 
 
 		 972 aa  46.2  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  22.27 
 
 		 822 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 986 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  23.6 
 
 		 730 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>